Ст 33 ч 1 п 3 тк рф: ТК РФ Статья 33. Представители работодателей / КонсультантПлюс

Содержание

Статья 33 ТК РФ 2016-2019. Представители работодателей. ЮрИнспекция

Зависит от разных обстоятельств: каким актом ит органом установлена компенсация, кто её получаетПисьмо Департамента налоговой и таможенно-тарифной политики Минфина РФ от 3 мая 2005 г. N 03-05-02-04/88Вопрос: В соответствии с пп. 9 п. 1 ст. 238, с п. 3 ст. 217 НК РФ (в редакции 2004 г. ) не подлежит налогообложению ЕСН и НДФЛ стоимость проезда работников и членов их семей к месту проведения отпуска и обратно, оплачиваемая налогоплательщиком лицам, работающим и проживающим в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностям, в соответствии с законодательством РФ. Статьей 325 Трудового кодекса РФ (в редакции 2004 г. ) предусмотрена обязанность работодателя оплатить стоимость проезда к месту использования отпуска работника, работающего в условиях Крайнего Севера, и обратно неработающим членам его семьи (мужу, жене, несовершеннолетним детям.) . В связи с выходом письма от 13 января 2005 г. N 03-03-01-04/1/7 просим разъяснить, подлежит ли налогообложению налогом на доходы физических лиц и ЕСН в 2004 г. оплата проезда совершеннолетнего ребенка, не достигшего возраста 23 лет, обучающегося в образовательном учреждении по очной форме и находящегося на иждивении работника, работающего в условиях Крайнего Севера, в случае если расходы по оплате данных компенсационных выплат будут учтены при налогообложении налогом на прибыль организаций в соответствии с п. 7 ст. 255 Налогового кодекса. Ответ: Департамент налоговой и таможенно-тарифной политики рассмотрел письмо от 17.03.2005 и сообщает следующее.Согласно пункту 1 статьи 236 Налогового кодекса Российской Федерации (далее — Кодекс) объектом налогообложения единым социальным налогом для налогоплательщиков, производящих выплаты физическим лицам, признаются выплаты и иные вознаграждения, начисляемые налогоплательщиками в пользу физических лиц по трудовым и гражданско-правовым договорам, предметом которых является выполнение работ, оказание услуг (за исключением вознаграждений, выплачиваемых индивидуальным предпринимателям) , а также по авторским договорам. Поскольку совершеннолетний ребенок, обучающийся в образовательном учреждении по очной форме, не состоит с налогоплательщиком в трудовых отношениях, то расходы по оплате его проезда к месту отдыха и обратно, не являются объектом обложения единым социальным налогомПисьмо Департамента налоговой и таможенно-тарифной политики Минфина РФ от 13 августа 2007 г. N 03-03-06/1/561Ответ: Департамент налоговой и таможенно-тарифной политики рассмотрел ваше письмо от 29.06.2007 N 0001-06/2332 по вопросу исчисления единого социального налога и учета в целях налогообложения прибыли расходов в виде оплаты работникам затрат по проезду к месту проведения отдыха и обратно и найму жилого помещения и сообщает следующее.В соответствии со статьей 325 Трудового кодекса Российской Федерации и статьей 33 Закона Российской Федерации от 19.02.1993 N 4520-1 «О государственных гарантиях и компенсациях для лиц, работающих и проживающих в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях» лица, работающие в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, имеют право на оплачиваемый один раз в два года за счет средств работодателя проезд к месту использования отпуска в пределах территории Российской Федерации и обратно любым видом транспорта, в том числе личным (за исключением такси) , а также на оплату стоимости провоза багажа весом до 30 килограммов. При этом размер, условия и порядок компенсации расходов на оплату стоимости проезда и провоза багажа к месту использования отпуска и обратно для лиц, работающих у работодателей, не относящихся к бюджетной сфере, устанавливаются коллективными договорами, локальными нормативными актами, трудовыми договорами.Пунктом 7 статьи 255 Налогового кодекса Российской Федерации (далее — Кодекс) определено, что в целях налогообложения налога на прибыль в состав расходов включаются расходы на оплату труда, сохраняемую работникам на время отпуска, преду

Информация для руководителей организаций, индивидуальных предпринимателей и представителей трудовых коллективов Республики Коми

Информация для руководителей организаций, индивидуальных предпринимателей и представителей трудовых коллективов Республики Коми

При заключении и направлении на уведомительную регистрацию коллективных договоров, соглашений необходимо соблюдать требования трудового законодательства и иных нормативных правовых актов, регулирующих данные отношения.

Порядок ведения коллективных переговоров и заключения коллективных договоров регулируется Главами 6-7 Трудового кодекса Российской Федерации (далее — ТК РФ).

Коллективный договор, соглашение подписывается полномочными представителями работников и работодателя, указанными в ст. 29 — 33, 37 ТК РФ.

Интересы работодателя при проведении коллективных переговоров, заключении или изменении коллективного договора представляют руководитель организации, работодатель — индивидуальный предприниматель (лично) или уполномоченные ими лица, интересы работников — профсоюзы либо иные представители, избранные работниками (ч. 1 ст. 33, ч. 2 ст. 29 ТК РФ).

Если первичная профсоюзная организация объединяет более половины работников организации, то в силу ч. 3 ст. 37 ТК РФ она вправе по решению своего выборного органа направить работодателю предложение о начале коллективных переговоров от имени всех работников без предварительного создания единого представительного органа.

Две или более профсоюзные организации, объединяющие в совокупности более половины работников, могут создать единый представительный орган, который будет представлять всех работников организации при ведении коллективных переговоров и заключении коллективного договора (ч. 2 ст. 37 ТК РФ).

Если работники не объединены в профсоюзные организации или ни одна из них не объединяет более половины работников, то на общем собрании сотрудников тайным голосованием может быть избран иной представитель или представительный орган из числа работников (ч. 1 ст. 31 ТК РФ).

При проведении коллективных переговоров, заключении или изменении соглашений интересы работодателей представляют соответствующие объединения работодателей, интересы работников соответствующие профсоюзы, их территориальные организации, объединения профессиональных союзов и объединения территориальных организаций профессиональных союзов (ч. 2 ст. 33, ч. 3 ст.29 ТК РФ).

При наличии на соответствующем уровне нескольких профсоюзов (объединений профсоюзов) каждому из них предоставляется право на представительство в составе единого представительного органа для ведения коллективных переговоров, формируемого с учетом количества представляемых ими членов профсоюзов. При отсутствии договоренности о создании единого представительного органа для ведения коллективных переговоров право на их ведение предоставляется профсоюзу (объединению профсоюзов), объединяющему наибольшее число членов профсоюза (профсоюзов) (ч. 6 ст. 37 ТК РФ).

Коллективный договор, соглашение в течение семи дней со дня подписания направляются работодателем, представителем работодателя (работодателей) на уведомительную регистрацию в соответствующий орган по труду. Согласно постановлению Правительства Республики Коми от 11 декабря 2015 года № 519 «О Министерстве труда, занятости и социальной защиты Республики Коми» государственная услуга по проведению уведомительной регистрации коллективных договоров, соглашений предоставляется Министерством труда, занятости и социальной защиты Республики Коми по адресу: г.Сыктывкар, ул. Интернациональная, 174, тел. 28-60-90.

Административный регламент предоставления государственной услуги по проведению уведомительной регистрации коллективных договоров, соглашений (далее – Административный регламент) утвержден приказом Министерства труда и социальной защиты Республики Коми № 764 от 21 апреля 2015 года и размещен на официальном сайте Министерства во вкладках «Административные регламенты» (раздел «Утвержденные административные регламенты»), «Социальное партнерство, раздел «Коллективные договоры» и находится в свободном доступе по ссылке http://mintrudsoc.

rkomi.ru/page/11947/34609/, а также в базе СПС КонсультантПлюс.

С порядком получения государственной услуги можно ознакомиться на портале Государственных услуг Республики Коми www.pgu.rkomi.ru. и на Едином портале государственных услуг www.gosuslugi.ru.

Для получения государственной услуги по проведению уведомительной регистрации соглашений, коллективных договоров пунктом 2.9. Административного регламента предусматривается предоставление следующих документов:

1) заявление о проведении уведомительной регистрации коллективного договора, соглашения по рекомендуемой форме, указанной в приложениях № 2, 3 к Административному регламенту;

2) коллективный договор, соглашение с приложениями, на которые есть ссылки в коллективном договоре, соглашении, подписанные сторонами, в количестве экземпляров по числу подписавших сторон и один экземпляр для Министерства;

3) копия протокола (выписка из протокола) общего собрания (конференции) работников о делегировании полномочий на представление интересов работников организации и подписание коллективного договора, уполномоченному лицу (для организаций, где отсутствует первичная профсоюзная организация, или ни одна из имеющихся первичных профсоюзных организаций не объединяет более половины работников данной организации), в одном экземпляре.

Заявление на проведение уведомительной регистрации коллективного договора, соглашения должно содержать в том числе следующую информацию: полное наименование организации (индивидуального предпринимателя), ОГРН (ОГРНИП), адрес регистрации (почтовый адрес), Ф.И.О. руководителя организации, Ф.И.О., телефон контактного лица, ОКВЭД, форму собственности, списочную численность работников, членов профсоюза (при наличии), количество организаций, охваченных соглашением (при направлении на уведомительную регистрацию соглашения).

При направлении коллективного договора, соглашения на уведомительную регистрацию необходимо соблюдать установленные требования документооборота и делопроизводства, в частности, коллективный договор, соглашение должен (должно) быть представлен(о) с приложениями, на которые есть ссылки в коллективном договоре, (соглашении) подписанный сторонами, в количестве экземпляров по числу подписавших сторон и один экземпляр для Министерства труда и социальной защиты Республики Коми, содержать титульный лист, содержание, подписи и печати (при наличии) полномочных представителей сторон.

Страницы коллективного договора, соглашения должны быть пронумерованы и прошиты.

Вышеуказанные требования Административного регламента и документооборота необходимо соблюдать и при направлении на уведомительную регистрацию изменений и дополнений в соглашения и коллективные договоры.

Изменение и дополнение коллективного договора (соглашения) производятся в порядке, установленном настоящим ТК РФ, либо в порядке, установленном коллективным договором (соглашением) (ст. 44, 49 ТК РФ).

Изменения и дополнения условий коллективного договора (соглашения) оформляются отдельным документом, который также направляется на уведомительную регистрацию в Министерство.

С примерной формой изменений и дополнений в коллективный договор можно ознакомиться на официальном сайте Министерства во вкладке «Социальное партнерство», разделе «Коллективные договоры» по ссылке http://mintrudsoc.rkomi.ru/page/11775/.

В соответствии со статьей 9 ТК РФ коллективные договоры не могут содержать условий, ограничивающих права или снижающих уровень гарантий работников по сравнению с установленным трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права.

Денежная выплата при расторжении служебного контракта по соглашению сторон

В законодательстве нет прямого запрета производить гражданскому служащему дополнительные выплаты при прекращении служебного контракта по соглашению сторон. Но следует учитывать, что законодательство не включает в фонд оплаты труда гражданских служащих дополнительные выплаты при увольнении. Кроме того, судебной практикой отмечается, что действующим законодательством не предусмотрены компенсационные выплаты при увольнении государственного гражданского служащего по соглашению сторон.

                 Согласно ст. 34 Федерального закона от 27.07.2004 N 79-ФЗ «О государственной гражданской службе Российской Федерации» (далее — Закон N 79-ФЗ) служебный контракт может быть расторгнут в любое время по соглашению сторон служебного контракта с одновременным освобождением гражданского служащего от замещаемой должности гражданской службы и увольнением с гражданской службы на основании п. 1 ч. 1 ст. 33 Закона N 79-ФЗ.

Закон N 79-ФЗ не регламентирует дополнительные выплаты при расторжении служебного контракта по данному основанию. Часть 10 ст. 50 Закона N 79-ФЗ допускает осуществлять гражданским служащим другие выплаты, предусмотренные соответствующими федеральными законами и иными нормативными правовыми актами.

Статьей 73 Закона N 79-ФЗ установлено субсидиарное применение законов и иных нормативных правовых актов, содержащих нормы трудового права.

В соответствии с ч. 4 ст. 178 Трудового кодекса РФ трудовым договором или коллективным договором могут предусматриваться другие случаи выплаты выходных пособий, а также устанавливаться повышенные размеры выходных пособий, за исключением случаев, предусмотренных ТК РФ.

Следовательно, выплату компенсации при расторжении трудового договора работодатель может предусмотреть в локальных нормативных актах или в трудовом договоре.

Соглашения о расторжении трудовых договоров, в соответствии со ст. 78 ТК РФ, с работниками, категории которых указаны в ч. 1 ст. 349.3 ТК РФ, не могут содержать условия о выплате работнику выходного пособия, компенсации и (или) о назначении работнику каких-либо иных выплат в любой форме. Гражданские служащие в данную категорию работников не входят.

Таким образом, в законодательстве нет прямого запрета производить гражданскому служащему дополнительные выплаты при прекращении служебного контракта по соглашению сторон на основании п. 1 ч. 1 ст. 33 Закона N 79-ФЗ. Но следует учитывать, что ст. 51 Закона N 79-ФЗ не включает в фонд оплаты труда гражданских служащих дополнительные выплаты при увольнении. Также в судебной практике отмечается, что действующим законодательством не предусмотрены компенсационные выплаты при увольнении государственного гражданского служащего по соглашению сторон (см. Апелляционное определение Московского областного суда от 08.06.2016 по делу N 33-14573/2016).

 

Более подробно с данным материалом Вы можете ознакомиться в СПС КонсультантПлюс  Вопрос: Может ли быть предусмотрена денежная выплата при расторжении служебного контракта по соглашению сторон? (Консультация эксперта, 2017) {КонсультантПлюс}

Ст 33 ТК РФ

Статья 33.

Представители работодателей

Интересы работодателя при проведении коллективных переговоров, заключении или изменении коллективного договора, а также при рассмотрении и разрешении коллективных трудовых споров работников с работодателем представляют руководитель организации, работодатель — индивидуальный предприниматель (лично) или уполномоченные ими лица в соответствии с настоящим Кодексом, другими федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации, законами и иными нормативными правовыми актами субъектов Российской Федерации, нормативными правовыми актами органов местного самоуправления, учредительными документами юридического лица (организации) и локальными нормативными актами.

При проведении коллективных переговоров, заключении или изменении соглашений, разрешении коллективных трудовых споров по поводу их заключения или изменения, а также при формировании и осуществлении деятельности комиссий по регулированию социально-трудовых отношений интересы работодателей представляют соответствующие объединения работодателей. В случае отсутствия на федеральном, межрегиональном, региональном или территориальном уровне социального партнерства отраслевого (межотраслевого) объединения работодателей его полномочия может осуществлять соответственно общероссийское, межрегиональное, региональное, территориальное объединение работодателей при условии, что состав членов такого объединения отвечает требованиям, установленным федеральным законом для соответствующего отраслевого (межотраслевого) объединения работодателей.

Части третья — четвертая утратили силу. — Федеральный закон от 24.11.2014 N 358-ФЗ.

Другие статьи ТК РФ

Статья 227. Несчастные случаи, подлежащие расследованию и учету

Статья 35.1. Участие органов социального партнерства в формировании и реализации государственной политики в сфере труда

Статья 417. Ответственность работников за незаконные забастовки

Трудовой кодекс Российской Федерации N 197-ФЗ ст 33 (с изм. и доп., вступ. в силу с 30.11.2021) (действующая редакция 2022)

Белок домена tudor, SIMR-1, способствует продукции siRNA на мРНК, нацеленных на piRNA, у C.

elegans

[Примечание редактора: авторы повторно представили на рассмотрение исправленную версию статьи. Далее следует ответ авторов на первый раунд обзора.]

Рецензент №1:

[…] В рукописи Manage et al. сообщается о новом компоненте механизма синтеза малой РНК C. elegans . SIMR-1 содержит TUDOR-подобный домен, часто встречающийся в белках, взаимодействующих с Argonaute.Протеомный анализ SIMR-1 показывает, что SIMR-1 взаимодействует с MUT-16, другими белками-фокусами Mutator и WAGO-1, Argonaute, который также взаимодействует с MUT-16. Подобно белкам Mutator foci, SIMR-1 необходим для синтеза и/или поддержания малых РНК, нацеленных на многие локусы (>600), включая ~100 локусов, также нацеленных на piRNAs. SIMR-1 локализуется в новой грануле, примыкающей к очагам Mutator. Авторы предполагают, что SIMR-1 может функционировать при «передаче» мРНК, на которые нацелены piRNAs, в фокусы мутаторов.Этот вывод, однако, не подтверждается данными, поскольку мутанты SIMR-1 влияют на многие другие гены помимо тех, на которые нацелены piRNAs (точка #1). SIMR-1 взаимодействует с Argonaute WAGO-1, но функциональная связь между SIMR-1 и WAGO-1 не исследовалась (точка №5).

Мы удалили все заявления о том, что SIMR-1 «отключает» РНК от пути piRNA к мутатору , и вместо этого указали, что SIMR-1 действует на этапе между продукцией piRNA и биогенезом siRNA, зависящим от мутатора -комплекса.Чтобы предоставить дополнительные доказательства того, что SIMR-1 действует на путь piРНК, а не на нижестоящий путь мутатора , мы включили данные, показывающие, что мутанты simr-1 , как и мутанты пути piРНК, де-молчают сенсибилизированный сенсор piРНК, но не датчик piRNA, заглушенный РНК, или ERGO-1-зависимый датчик siRNA (рис. 4A и рис. 4 — дополнение к рисунку 1A-B). Кроме того, SIMR-1 необходим для повышения фертильности после восстановления продукции WAGO-класса 22G-siRNAs, фенотип также связан только с мутантами пути piRNA (рис. 4В).

1) Авторы проводят всесторонний анализ дефектов малых РНК у мутантов SIMR-1, выращенных при различных температурах, и идентифицируют около ~1000 пораженных локусов. В соответствии с тем, что SIMR-1 взаимодействует с каркасом Mutator MUT-16,> 90% генов, затронутых у мутантов simr-1, также затронуты у мутантов mut-16. Эти гены включают в себя гены-мишени для piRNAs, но последние представляют лишь меньшинство (<20%) генов, пораженных у мутантов simr-1, поэтому неясно, почему авторы так много внимания уделяют этим генам.

В первой версии этой рукописи мы использовали дополнительную таблицу 2 от Lee et al., 2012, чтобы определить цели piRNA. Этот список содержит примерно 300 генов, для которых авторы наблюдали 8-кратное обогащение 22G-миРНК в FLAG::PRG-1 по сравнению с мутантами prg-1 , и, вероятно, не является исчерпывающим списком prg-1 -зависимых 22G. -целевые локусы миРНК. Таким образом, мы создали новые библиотеки малых РНК из мутантов дикого типа и prg-1 мутантов при 20°C и определили prg-1 -зависимых генов-мишеней миРНК как гены с не менее чем двукратным снижением общего количества малых РНК и при не менее 10 RPM в библиотеках дикого типа или мутантных (те же критерии, по которым мы определили simr- 1-зависимых генов-мишеней siRNA). Используя эти новые библиотеки, мы создали более полных списков из 1758 prg-1 -зависимых генов-мишеней миРНК. С этим большим списком теперь 686 (из 817) или 84% из simr-1 -зависимых генов-мишеней siRNA перекрываются с prg-1 -зависимых генов-мишеней siRNA при 20 ° C (рис. 5D). При 25°C 693 (из 1258) или 55% из simr-1 -зависимых генов-мишеней siRNA перекрываются с prg- 1-зависимых генов-мишеней siRNA (рис. 5 — дополнение к рисунку 1C).Важно отметить, что в последнем случае библиотеки simr-1 , собранные при 25°C, сравниваются с библиотеками prg-1 , собранными при 20°C, и эта разница в температуре может объяснять меньшее перекрытие. между simr-1 и prg-1 -зависимыми генами-мишенями миРНК. При обеих температурах большинство из мишеней simr-1 (94% при 20°C и 80% при 25°C) все еще перекрываются с mut-16 -зависимыми генами-мишенями siRNA (рис. 5D и рис. 5 — дополнение к рисунку). 1С).

Мы также получили два аллеля simr-1 из скрининга, чтобы де-молчать сенсорный штамм piRNA (рис. 4A), и продемонстрировали, что SIMR-1 необходим для повышения фертильности после восстановления Продукция 22G-siRNA класса WAGO, фенотип, ранее наблюдаемый только у мутантов в известных факторах пути piRNA prg-1 , pid-1 и henn-1 (рис. 4B), дает дополнительные доказательства того, что SIMR-1 важен для продукции siRNAs в локусах-мишенях piRNA.

2) «мутанты simr-1 не способны продуцировать высокие уровни siRNAs из большинства локусов-мишеней piRNA». Рисунок 4C, по-видимому, противоречит этому утверждению, поскольку при 20°C затрагивается только <50% локусов-мишеней piRNA. Кроме того, какие критерии использовались для определения «локусов, нацеленных на пиРНК»? Новые анализы, проведенные в лабораториях Мелло и Ли, выявили сайты связывания piRNA в сотнях мРНК, на которые нацелены комплексы PRG-1/piRNA. Что происходит с этими локусами у мутантов simr-1? Малые РНК полностью исчезли или уменьшились? Являются ли малые РНК, расположенные ближе всего к сайтам связывания piРНК, наиболее или наименее затронуты? есть ли конкретная картина потери?

Это предложение было изменено, чтобы сказать, что мутанты simr-1 не способны продуцировать высокие уровни siRNAs во многих локусах-мишенях piRNA. См. предыдущий ответ для получения более подробной информации о том, как мы определили локусы-мишени piRNA (те, у которых по крайней мере 2-кратное снижение общего количества малых РНК в prg-1 мутантах и ​​по крайней мере 10 RPM в библиотеках дикого типа или prg-1 ) . Несмотря на значительное перекрытие между генами, которые мы определили как simr-1 -зависимых локусов siRNA и prg-1 -зависимых siRNA локусов, существует также много prg-1 -зависимых локусов siRNA, которые не соответствуют критериям которые мы использовали для определения simr-1 -зависимых локусов миРНК.Обратите внимание, однако, что многие из них имели уменьшенное количество siРНК у мутанта simr-1 , но не соответствовали используемому нами 2-кратному порогу (см. диаграмму на рисунке 5B, где более 75% генов-мишеней piRNA имеют уменьшенное количество siРНК в мутант simr-1 ).

Что касается сайтов связывания piRNA, мы решили сосредоточиться конкретно на piRNA, экспрессия которых изменяется у мутанта simr-1 (рис. 5F и дополнительный файл 4). Мы идентифицировали 77 piРНК (менее 1% всех piРНК), которые по крайней мере в 2 раза подавлены у мутанта simr-1 .Используя piRTarBase (который собирает сайты связывания piRNA, идентифицированные лабораториями Mello и Lee), мы идентифицировали 37 мРНК, которые являются предполагаемыми мишенями для этих piRNA по смягченным правилам нацеливания piRScan (лаборатория Lee) и данным CLASH (лаборатория Mello). Мы решили изучить сайты, которые были общими для обоих этих методов, потому что Wu et al., 2019 продемонстрировали, что только когда они исследовали сайты-мишени piRNA, общие между этими двумя методами, это предсказывало увеличение экспрессии мРНК и снижение на уровнях 22G у мутанта prg-1 ; гены, идентифицированные любым методом по отдельности, не были значимо прогностическими.Из этих 37 мРНК, которые являются предполагаемыми мишенями piРНК, затронутыми у мутанта simr-1 , только пять имеют сниженные уровни siRNAs у мутанта simr-1 (см. Дополнительный файл 4). Эти данные показывают, что piRNAs с истощением simr-1 не являются основным фактором истощения siRNA у мутантов simr-1 .

3) Авторы утверждают, что дефект должен быть «ниже по течению от piRNAs», потому что уровни piRNAs в целом не затрагиваются у мутантов SIMR-1.Однако они не сообщают об уровнях специфических piРНК, которые нацелены на ~ 100 генов, нацеленных на piRNA, затронутых у мутанта simr-1. Уровни белка PRG-1 (пиРНК-ассоциированного аргонавта) также не сообщаются.

См. предыдущий ответ. Сначала мы идентифицировали все piРНК, экспрессия которых снижена в 2 раза у мутантов simr-1 из (всего 77 piРНК), а затем продемонстрировали, что предсказанные мРНК-мишени для этих piРНК в целом не обеднены малыми РНК в simr-1. 1 мутант.В целом, только пять из 817 генов, редуцированных как минимум в 2 раза, являются прямыми мишенями этих 77 « simr-1 -зависимых» piРНК. Мы дополнительно добавили вестерн-блоттинг для PRG-1, показывающий, что на уровни PRG-1 не влияет мутант simr-1 (рис. 7 — дополнение к рисунку 1C).

4) Коррелируют ли изменения малых РНК, наблюдаемые у мутантов simr-1, с изменениями уровней мРНК?

Большинство генов, лишенных малых РНК в simr-1 , не затрагиваются на уровне мРНК.Напротив, гены, обогащенные малыми РНК, как правило, имеют пониженную экспрессию на уровне мРНК (рис. 6Н). Неспособность генов, лишенных малых РНК, повышать экспрессию на уровне мРНК, согласуется с недавними наблюдениями Reed et al., 2019, рассматривающими все мутаторов-мишеней , и Barucci et al., 2020, рассматривающих мишени piRNA. . В обоих случаях большинство генов, лишенных малых РНК, не увеличивали экспрессию мРНК. Эти данные указывают на то, что могут существовать дополнительные уровни регуляции генов, которые поддерживают молчание этих генов в отсутствие siRNAs.

5) SIMR-1 взаимодействует с Argonaute WAGO-1, но авторы не исследуют потенциальные функциональные связи между SIMR-1 и WAGO-1 – почему? Есть ли хорошее перекрытие между WAGO-1-зависимыми локусами и SIMR-1-зависимыми локусами?

MUT-16 взаимодействует с WAGO-1 посредством иммунопреципитации и дрожжевого бигибрида, но у нас нет доказательств того, что SIMR-1 взаимодействует с WAGO-1. Поэтому мы не рассматривали эту возможность.

6) Рисунок 6: Отсутствует показанная систематическая количественная оценка относительного положения гранул.См. Wan et al., 2018, примеры количественных показателей. Выводы авторов предполагают, что это 4 различных типа перинуклеарных конденсатов в зародышевых клетках – все ли они присутствуют в пропорции 1:1:1:1? Является ли каждая гранула P рядом с гранулой Z рядом с гранулой SIMR-1 рядом с фокусом мутатора, или порядок и состав различаются?

Мы добавили количественную оценку, показывающую процент фокусов SIMR-1, которые связаны с гранулами P, гранулами Z и фокусами Mutator .Кроме того, мы включили количественную оценку расстояний между центрами флуоресценции для каждого из этих фокусов по отношению к фокусам SIMR-1 (рис. 7B) и указали, что в некоторых случаях мы можем наблюдать несколько очагов SIMR-1, взаимодействующих с гранулами другого типа (см. Рисунок 7A, стрелка на вставке для локализации SIMR-1 и ZNFX-1). Эти данные показывают, что, хотя SIMR-1 обычно связан с тремя другими гранулами, он не обязательно находится в пропорции 1:1:1:1. Мы также заметили, что не все гранулы P связаны с гранулами SIMR/Mutator/Z.В настоящее время мы не знаем, почему только некоторые гранулы P связаны с этими другими гранулами, однако мы проводим количественную оценку и дальнейшее исследование в другой рукописи.

Рецензент №2:

В этой рукописи Manage et al. идентифицировали ранее не охарактеризованный белок, названный SIMR-1, который взаимодействует с компонентом очагов мутаций, MUT-16, и участвует в накоплении подмножества эндо-siRNAs, антисмысловых по отношению к piRNA и мутаторным генам-мишеням. Они также показывают, что мутант simr-1 демонстрирует зависимую от температуры прогрессирующую потерю фертильности, сходную с мутацией в нижестоящих компонентах пути piRNA.Интересно, что они показали, что SIMR-1 имеет перинуклеарную локализацию в области, отличной от p-гранулы, z-гранулы или фокусов мутаторов, и что его локализация не зависит от фокусов мутаторов. Более того, путем выравнивания последовательностей они идентифицировали белок с расширенным доменом Tudor, который потенциально может взаимодействовать с метилированным белком PIWI. Основываясь на этих результатах, они предполагают, что SIMR-1 представляет собой отдельную зародышевую гранулу, которая действует ниже PIWI и piRNAs для транспорта мРНК, на которые нацелены piRNAs, из p-гранулы в мутаторные очаги (гранулы, участвующие в амплификации эндо-siRNAs).В целом, отчетливая перинуклеарная локализация этого белка является захватывающей, однако нет никаких экспериментов, подтверждающих утверждение о том, что этот белок играет роль в транспорте мРНК из пути piRNA к расположенным ниже по течению мутаторным очагам, а также о том, что предполагаемый домен Tudor является функциональным. Я также выражаю некоторую озабоченность по поводу методов, анализа данных и интерпретации некоторых ключевых результатов, перечисленных ниже.

Мы удалили все заявления о том, что SIMR-1 транспортирует РНК от piРНК к пути мутатора , и вместо этого указали, что SIMR-1 действует на этапе между продукцией piРНК и мутатором — комплекс-зависимым биогенезом siРНК. Мы также добавили данные, демонстрирующие работоспособность домена Tudor (см. ответ на пункт «B» ниже). Наконец, мы рассмотрели все конкретные комментарии об анализе данных и будем рады предоставить любую другую информацию, если это потребуется рецензентом.

A) Авторы выполнили IP MUT-16 в сочетании с масс-спектрометрией, чтобы идентифицировать новые взаимодействующие факторы мутаторного комплекса. Мое первое беспокойство связано с тем фактом, что авторы не указали, сколько реплик IP они использовали и какие статистические методы они использовали для идентификации конкретных взаимодействующих в IP MUT-16 по сравнению с контрольными IP.Похоже, что они рассмотрели взаимодействующие белки, которые имеют пептиды только в MUT-16 GFP и FLAG IP, а не в контроле. Этот подход может ограничить количество взаимодействующих белков, идентифицируемых в IP. Кроме того, количество пептидов, которые они идентифицировали для SIMR-1, чрезвычайно мало (2 пептида в IP FLAG и 1 пептид в IP GFP), что вызывает сомнения в том, что SIMR-1 является реальным взаимодействующим фактором MUT-16. Из-за отсутствия статистических инструментов, используемых для идентификации взаимодействующих белков, я предлагаю им провести эксперименты Co-IP, чтобы подтвердить это взаимодействие.Также неизвестно, является ли это взаимодействие прямым или опосредованным РНК, и такой эксперимент, как Co-IP, может помочь определить природу их взаимодействий. Кроме того, на рисунке 1А они включают белки RSD-2, WAGO-1 и MATH-33, которые были идентифицированы с помощью другого (неясного) подхода (их пептиды не присутствуют однозначно в IP MUT-16). Поэтому его следует удалить из этой таблицы. Опять же, если они хотят принять во внимание такие случаи, они должны использовать количественный протеомный подход, используя больше повторов и статистические инструменты.

Для каждой иммунопреципитации (MUT-16-FLAG, MUT-16-GFP, контроль-FLAG, контроль GFP) был выполнен только один повтор, поэтому мы не проводили статистический анализ. Этот подход рассматривался как скрининг для выявления генов-кандидатов для дальнейшего исследования, а не как исчерпывающий список истинных взаимодействующих MUT-16. Мы удалили RSD-2, WAGO-1 и MATH-33 из таблицы на рисунке 1 в соответствии с просьбой. Поскольку мы провели дальнейший анализ этих белков (локализация и последовательность малых РНК), которые показаны на других рисунках, вместо этого они были включены в рисунок 1 — дополнение к рисунку 1 вместе с количеством пептидов в контрольных штаммах, чтобы было ясно, что эти три белка были идентифицированы при гораздо более низком охвате в контрольном FLAG IP.

Мы попытались подтвердить ко-IP SIMR-1-MUT-16, чтобы продемонстрировать, что это истинное взаимодействие, однако наши результаты были неубедительными. Мы считаем, что этот результат предполагает, что взаимодействие между MUT-16 и SIMR-1 может быть слабым или преходящим, что неудивительно, учитывая их локализацию в разных компартментах и ​​тот факт, что SIMR-1 не требуется для производства экзогенной РНКи или малой РНК. во многих мутаторных генах-мишенях.

B) Отсутствуют функциональные данные или структурная информация для оценки того, что консервативные остатки, содержащиеся в SIMR-1, составляют домен Tudor, способный распознавать метилированный субстрат, такой как PIWI. Кроме того, эксперименты SIMR-1 IP и масс-спектрометрии не позволили идентифицировать белок PRG-1/PIWI. Основным интерактором, идентифицированным с помощью масс-спектрометрии, вместо этого является RSD-2, который, как они показывают, колокализуется в тех же перинуклеарных очагах, что и SIMR-1, хотя, по-видимому, выполняет другую функцию (RSD-2 участвует в РНКи, а не в амплификации 22G-РНК). из мишеней piРНК, а SIMR-1 участвует не в РНКи, а в накоплении 22G-РНК из мишеней piРНК). Следовательно, отчетливая локализация SIMR-1 сама по себе не означает, что SIMR-1 опосредует передачу мРНК от пути piRNA к нижестоящим компонентам Mutator.Кроме того, количество пептидов предполагаемых взаимодействующих элементов SIMR-1, показанных на Рисунке 6 — приложение к рисунку 1, чрезвычайно низкое, что вызывает опасения по поводу качества экспериментов IP/масс-спектрометрии. Опять же, не указано, сколько повторений было выполнено. Следовательно, некоторые из этих взаимодействий, такие как MUT-16/SIMR-1, должны быть подтверждены Co-IP.

Чтобы продемонстрировать, что Tudor-домен SIMR-1 является функциональным, мы сделали одну точечную мутацию в критическом остатке для структуры расширенного Tudor-домена и обнаружили, что SIMR-1 больше не локализуется в перинуклеарных гранулах (рис. 4C).Кроме того, эти мутантные животные имеют трансгенерационные дефекты фертильности при повышенной температуре, сходные с делеционным аллелем simr-1 (рис. 4D). Этот же аллель был также идентифицирован при беспристрастном скрининге де-молчания сенсора piRNA (рис. 4А). Хотя эти данные не доказывают, что домен Tudor SIMR-1 может распознавать метилированные пептиды, они подтверждают идентификацию домена Tudor и указывают на его критическую роль в функции SIMR-1.

Мы удалили эксперимент с масс-спектрометрией SIMR-1 из-за низкого количества пептидов и отсутствия повторов.Мы попытались воспроизвести взаимодействие MUT-16-SIMR-1 с помощью co-IP, но, как описано в предыдущем пункте, результаты были неубедительными. Тем не менее, SIMR-1 явно играет роль в продукции siRNAs из мишеней piRNA на основе его фенотипов. Мы планируем вернуться к непосредственным взаимодействующим сторонам SIMR-1 в будущей работе.

C) Авторы провели анализ малых РНК-секвенций, чтобы проверить, затронуты ли определенные популяции малых РНК у мутанта simr-1. Они выполнили профили малых РНК в различных условиях (нормальная температура роста или 25 ° C в нескольких поколениях), возможно, для того, чтобы сопоставить изменения экспрессии генов с зависимой от температуры прогрессирующей потерей фертильности фенотипа.Однако отсутствие соответствующих профилей RNA-seq не позволяет исследовать влияние температуры на экспрессию генов и то, как оно коррелирует с фенотипом прогрессирующего бесплодия. Более того, наиболее драматические изменения малых РНК у мутанта SIMR-1 происходят при 25°C уже через одну генерацию. Таким образом, нет корреляции между прогрессирующей потерей фертильности и изменениями малых РНК. Тогда мне интересно, имеют ли вообще отношение к текущей рукописи результаты поколения мутанта SIMR-1, выращенного при 25°C.Следовательно, единственный вывод из всех проведенных анализов заключается в том, что SIMR-1 каким-то образом участвует в накоплении подмножества мишеней mut-16 и piRNA. Вместо этого неясно влияние температуры на биогенез малых РНК.

Мы добавили панель, показывающую снижение картирования малых РНК с генами-мишенями piРНК у мутантов simr-1 в течение 10 поколений при 25°C (рис. 5 — дополнение к рисунку 1D). Кроме того, мы добавили в рукопись данные mRNA-seq, отчасти для того, чтобы решить, можем ли мы соотнести какие-либо изменения экспрессии генов с фенотипом прогрессирующего бесплодия.Мы обнаружили, что некоторые мутаторные мишени , мишени PRG-1 и гены сперматогенеза активируются исключительно в поздних (стерильных или почти стерильных) поколениях, однако аналогичные классы генов также активируются при 20°C (рис. 6G). ). Таким образом, трудно приписать фенотип бесплодия пониженной или повышенной экспрессии определенного класса генов. Мы наблюдаем дефекты в экспрессии мРНК гистонов (рис. 6I и рис. 6 — дополнение к рисунку 1G), которые, по мнению Barucci et al., 2020, приводят к бесплодию у prg-1 животных; однако у мутантов simr-1 снижение экспрессии мРНК гистонов наблюдается даже при 20°С, что позволяет предположить, что оно не может быть единственной причиной дефекта фертильности.Поэтому мы согласны с автором обзора в том, что большая часть изменений в экспрессии малых РНК происходит даже при 20°C или после одного поколения при 25°C — мы предполагаем, что эта потеря piРНК и мутатора -мишени малых РНК повышает чувствительность животных. к дефектам фертильности при повышенной температуре, но это не может быть прямым эффектом.

D) Кроме того, проведенный ими анализ малых РНК не очень убедителен. Например, в некоторых случаях неясно, использовались ли критерии для определения генов с уменьшением или увеличением малых РНК. Кроме того, методы не показывают четко, какие малые РНК они рассматривают (22G-РНК, 26G-РНК, смысловые, антисмысловые, широкий спектр малых РНК размером 21–26 нуклеотидов и т. д.). Поскольку это малые РНК, клонированные из полных РНК, а не из AGO IP, авторы не могут быть уверены, что наблюдаемое увеличение или уменьшение малых РНК относится к определенному пути AGO (известно, что мутация в каком-то факторе биогенеза малых РНК вызывает неправильную маршрутизацию малые РНК в AGO). В общем, похоже, что мутация в SIMR-1 вызывает общее подавление (не полную потерю) малых РНК, которые считаются зависимыми от mut-16 (включая некоторые ранее определенные мишени piRNA).Среди этих затронутых генов мишени piRNA кажутся более затронутыми, чем цельные мишени mut-16.

Мы уточнили рисунки и подписи к ним, чтобы указать, какие классы малых РНК мы исследуем. В общем, мы смотрим на общее количество малых РНК, сопоставленных с определенным классом генов, и не ограничиваем их размером, 5′-нуклеотидом или скрученностью. Что касается piРНК, мы рассмотрели только малые РНК, картирующиеся с аннотированными локусами piРНК. Мы не утверждаем, что эти малые РНК связывают определенные белки Argonaute, а только то, что они картируются с известным мутатором , piRNA, CSR-1 и т. д. генами-мишенями.Наконец, используя наши новые данные о малой РНК мутанта prg-1 , мы показываем, что большинство мишеней simr-1 также являются мишенями piRNA, в дополнение к мишеням мутатора (рис. 5D).

E) Авторы утверждают, что SIMR-1 действует ниже пути piRNA, однако они не провели никаких экспериментов, чтобы доказать, что сайленсинг piRNA нарушен у мутанта simr-1. Они должны использовать канонический штамм сенсора piRNA (Ashe et al., 2012) и проверить, нарушено ли молчание репортера сенсора piRNA у мутанта simr-1.Этот эксперимент хорошо сочетается с другими анализами, которые они использовали, чтобы показать, что мутант simr-1 не влияет на RNAi.

Теперь мы добавили выделение двух аллелей simr-1 из сенсорного экрана piRNA (впервые описанного в de Albuquerque, Genes Dev 2014), чтобы продемонстрировать, что simr-1 может деактивировать сенсибилизированный piRNA сенсор (рис. 4A), но не датчик piRNA, заглушенный РНК (рис. 4 — дополнение к рисунку 1A). Кроме того, мы продемонстрировали, что SIMR-1 необходим для стимулирования фертильности после восстановления продукции 22G-siRNA класса WAGO, фенотип, который ранее наблюдался только у мутантов в известных факторах пути piRNA prg-1 , pid-1 , и henn-1 (фиг. 4B), предоставляя дополнительные доказательства того, что SIMR-1 важен для продукции siRNAs в локусах-мишенях piRNA.

Особые комментарии:

1) Добавьте на рис. 2C статистическую значимость этих изменений.

Библиотеки на рис. 2C считались частью скрининга для выявления новых факторов малых РНК и не проводились с повторами, поэтому статистика не была включена. Все последующие последовательности малых РНК и мРНК, ориентированные на simr-1 (рис. 5-6 и рис. 5 — дополнение к рисунку 1 и рис. 6 — дополнение к рисунку 1), были выполнены с использованием библиотек с несколькими репликами и включали статистику.

2) Добавьте на рис. 2D гены со статистически значимым повышением и понижением уровня регуляции (или >2-кратным изменением). Они также могут помечать важные точки разными цветами. То же самое в 2E, если есть.

Цвета изменены, чтобы выделить гены с log 2 (кратное изменение) в количестве малых РНК больше или меньше 1.

3) На рисунке 4C общее количество генов, принадлежащих piRNA, ERGO-1 и mut-16, меняется на разных диаграммах Венна.Это не ясно. Не должно быть постоянным?

Эти конкретные диаграммы Венна были заменены, однако на исходном рисунке для простоты на диаграмме не показаны перекрытия менее 10 генов.

4) Подраздел «мутанты simr-1 имеют повышенный уровень апоптоза зародышевых клеток», название абзаца вводит в заблуждение. Уровень апоптоза зародышевой линии у SIMR-1 сходен с WT при 20°C и ниже, чем у WT при 25°C (первое поколение). Он несколько выше, чем соответствующий WT на поколениях 2, 10, 11 и не меняется на поколениях 4,7. Важно отметить, что WT при 25 ° C (1 поколение) имеет самый высокий уровень апоптоза зародышевой линии по сравнению со всеми другими точками данных и все же остается фертильным. Следовательно, сообщаемый уровень апоптоза зародышевой линии не коррелирует с фенотипом бесплодия. Вот почему я не согласен с интерпретацией Авторами результатов, показанных на рисунке 3E, и выводом, который они написали в подразделе «мутанты simr-1 имеют повышенный уровень апоптоза зародышевых клеток».

Мы изменили название этого раздела, чтобы указать, что усиление апоптоза специфически связано с фенотипом Mrt в поколениях 10 и 11.Мы согласны с тем, что столь значительное увеличение апоптоза в первом поколении при 25°C является странным, однако мы интерпретируем это как реакцию на тепловой стресс. Ко второму поколению при 25°C животные акклиматизировались к повышенной температуре, и апоптоз снижался. Только у животных позднего поколения при 25°C мы наблюдаем повышенный апоптоз у мутанта simr-1 по сравнению с диким типом. Хотя мы не утверждаем, что апоптоз является причиной бесплодия, мы считаем, что увеличение апоптоза в поздних поколениях, которое гораздо более значимо, чем любые различия, наблюдаемые в более ранних поколениях, коррелирует со снижением фертильности у этих животных.

5) Первый абзац подраздела «SIMR-1 необходим для продукции малой РНК в генах-мишенях piRNA» содержит результаты, которые не показаны ни на одном рисунке. Пожалуйста, предоставьте цифру, которая сообщает об этих результатах. Кроме того, не написано, какие критерии они использовали для выявления изменений в популяциях малых РНК (изменения кратности, p-значение?), а также из Материалов и методов или текста не известно, какие малые РНК они рассматривают (22G-РНК, 26G-РНК, смысловые, антисмысловые, широкий спектр малых РНК 21-26 нт и т. д.). Кроме того, гены с истощением малых РНК при 25°C (которые не истощаются в последующих поколениях) вновь приобретают малые РНК в прогрессивных поколениях?

Мы добавили таблицы, чтобы указать общее количество генов с изменениями в малых РНК или мРНК для каждого генотипа и состояния (рис. 5A и рис. 6F). Подробная информация о критериях, используемых для определения генов с изменениями малых РНК и мРНК, а также типы анализируемых малых РНК добавлены в соответствующие подписи к рисункам и в Материалы и методы.

Для генов, которые теряют малые РНК у мутантов simr-1 , обнаружено, что большинство генов теряют малые РНК в различных условиях (температура или поколение). Для генов, теряющих малые РНК у мутантов simr-1 только в первом поколении при 25°С, но не при 20°С или более поздних поколениях при 25°С (всего ~300 генов), некоторые из этих генов имеют повышенные малые РНК в штамме дикого типа только в этом состоянии и теряются в последующих поколениях, в то время как другие теряют малые РНК, которые затем восстанавливаются в более поздних поколениях.В тех случаях, когда гены, по-видимому, приобретают малые РНК у мутантов simr-1 только в первом поколении при 25°C, но не при 20°C или в более поздних поколениях при 25°C, многие из этих генов на самом деле имеют редуцированные малые РНК. РНК в штамме дикого типа в этом поколении, которые восстанавливаются в более поздних поколениях. На самом деле существует много генов, которые приобретают и теряют малые РНК в штамме дикого типа при повышенной температуре и в разных поколениях, но этот анализ выходит за рамки настоящей статьи, поэтому мы не включили данные.

6) Результаты анализов, показанные в подразделе «мутанты simr-1 имеют повышенные уровни картирования siRNAs в гены гистонов», также неясны и, возможно, не относятся к данной рукописи. Описанные результаты не имеют ссылки на рисунок. Они показаны на дополнительной фигуре 5B? Кроме того, на дополнительной фигуре 5B показаны только обедненные миРНК, а не обогащенные миРНК. Кроме того, они рассматривают только списки генов, лишенных 22G-РНК. Возможно, если они рассмотрят log2 (кратные изменения), они найдут более проницательные результаты.Что касается малых РНК, нацеленных на мРНК гистонов, они процитировали представленную статью (не уверены, можно ли указать журнал, в котором представлена ​​статья) и пришли к выводу, что это может иметь значение. Мутация в MUT-16, которая связана с путем piRNA, не показывает те же малые РНК гистонов. Более того, малые РНК гистонов присутствуют при любой температуре, поэтому также не коррелируют с прогрессирующей потерей фертильности у мутанта SIMR-1. Опять же, я не уверен, как этот абзац согласуется со всей рукописью.

Мы считаем, что данные гистонов подтверждают наш аргумент о том, что simr-1 действует на путь piRNA (а не на путь мутатора ). Статья, упомянутая в первоначальном представлении этой рукописи, теперь опубликована в журнале Nucleic Acids Research (Reed et al., 2019). Недавно также была опубликована дополнительная статья по этой теме (Barucci et al., 2020), обе из которых демонстрируют, что повышенное картирование малых РНК с генами гистонов и сниженная экспрессия мРНК гистонов являются фенотипом, связанным с путем piRNA.Обе статьи также демонстрируют, что эти малые РНК, картирующие гистоны, зависят от комплекса мутатора в своем биогенезе, поэтому, если они присутствуют, комплекс мутатора должен быть функциональным. Таким образом, эти данные помещают simr-1 в путь piRNA, выше мутатора комплексно-зависимого биогенеза этих гистоновых малых РНК.

Предложения, в которых не было ссылки на фигуру, были удалены. Дополнительная фигура 5B была удалена и заменена фигурой 6B-C, на которой показаны гены, обогащенные малыми РНК в мутантах prg-1 , mut-16 и simr-1 , а также корреляция генов, обогащенных малыми РНК. РНК у мутантов prg-1 и simr-1 с генами гистонов.Все списки генов, обогащенных малыми РНК, описаны на рисунке 5A и в дополнительном файле 3.

7) В разделе «Обсуждение» авторы утверждают, что их работа «дает представление о том, как мРНК перемещаются между путем piRNA и мутаторным комплексом, и предполагает роль множественных околоядерных конденсатов в содействии piRNA-опосредованному сайленсингу мРНК». Это не было продемонстрировано. Нет никаких экспериментов, показывающих, что мРНК, являющиеся мишенями piRNAs, перемещаются через перинуклеарные конденсаты SIMR-1 в фокусы Mutator, или что SIMR-1 необходим для молчания piRNA. Снижение подмножества мишеней piRNA может быть косвенным следствием функции SIMR-1, которая до сих пор остается неизвестной. Таким образом, я предлагаю удалить это предложение. То же самое для предложений в последнем абзаце подраздела «RSD-2 и SIMR-1 способствуют взаимодействию между различными первичными и вторичными путями миРНК».

Оба предложения были отредактированы, чтобы удалить формулировку, указывающую на трафик или хендовер между путем piRNA и комплексом мутатора, и просто указать, что SIMR-1 действует ниже по течению биогенеза piRNA и выше по течению зависимой от комплекса мутатора амплификации siRNA.

8) В разделе «Материалы и методы» авторы должны добавить подробный протокол, используемый для иммунопреципитации и масс-спектра (используемый буфер и т. д.). Упомянутый Uebel et al. не содержат такой информации. Кроме того, необработанные протеомные данные не были опубликованы. Кроме того, они должны добавить полное описание анализа малых РНК, выполненного, как указано выше.

Раздел «Материалы и методы», посвященный характеристикам IP/массы, был обновлен, чтобы включить используемые буферы, а раздел «Биоинформатический анализ» был изменен, чтобы включить более подробную информацию об используемых пакетах и ​​проведенном анализе.Таблица всех данных масс-спектрометрии была включена в качестве дополнительного файла 2. Мы будем рады предоставить любые дополнительные сведения по запросу рецензента.

[Примечание редактора: далее следует ответ авторов на второй этап рецензирования.]

Рецензент №2:

[…] 1) Даже если Авторы удалили из основного текста все утверждения о том, что «SIMR-1 «отключает» РНК от пути piРНК к пути мутатора», отрывок в Реферате, в котором говорится: «Однако, как мРНК сначала распознаваемые путем piRNA, затем передаются пути мутатора, неясно.Здесь мы идентифицируем белок тюдоровского домена, SIMR-1, поскольку он действует на этом этапе между продукцией piRNA и зависимым от мутаторного комплекса биогенезом siRNA», что все еще сбивает с толку, предполагая, что SIMR-1 действует на этом этапе.

Мы отредактировали Резюме, чтобы исключить предположение о том, что происходит «передача».

2) Авторы показали постепенное снижение количества малых РНК у мутанта simr-1 по сравнению с диким типом в разных поколениях при 25°C в новом приложении к рисунку 5 — рисунку 1D.Однако тепловая карта, показанная на фигуре 5C, предполагает, что снижение малых РНК (даже в поколении 10) у мутанта simr-1 более мягкое по сравнению с мутантом prg-1. Поэтому я рекомендую включить в рисунок 5 — дополнение к рисунку данные 1D для мутанта prg-1 при 20°C и рассчитать значимые изменения в siРНК между мутантами prg-1 и simr-1. Если истощение малой РНК у мутанта prg-1 более серьезное, чем у мутанта simr-1 (как это видно из рисунка 5C), то авторам следует пересмотреть свое утверждение о том, что SIMR-1 действует ниже пути piRNA, чтобы продуцировать siRNAs в мутаторных очагах. .SIMR-1 может взаимодействовать для накопления малых РНК ниже piRNAs вместе с другими путями или белками (действуя вместе или независимо от SIMR-1 при piRNA-зависимом накоплении малых РНК). Кроме того, влияние на накопление малых РНК все еще может быть косвенно связано с piRNA-зависимым биогенезом малых РНК, поскольку Co-IP не показал взаимодействия между SIMR-1 и PIWI или MUT-16. Поэтому эти альтернативные возможности следует обсудить в тексте.

Мы добавили линию на рис. 5 — дополнение к рисунку 1D, ниже которого попадают все мишени piРНК (поскольку список генов-мишеней piРНК был определен как уменьшенный в 2 раза у мутанта prg-1 ).Мы согласны с тем, что рецензент делает правильное замечание о том, что гены-мишени piRNA редуцируются из siRNAs в prg-1 более сильно, чем в simr-1 , даже в поздних поколениях. Таким образом, мы скорректировали текст, чтобы отразить, что стерильность вряд ли может быть вызвана этой потерей постепенной потери siРНК в simr-1 , так как prg-1 был фертильным в то время, когда у него была еще большая потеря siРНК в эти гены. Мы дополнительно изменили первый абзац обсуждения, чтобы указать, что фенотипы simr-1 слабее, чем фенотипы prg-1 , предполагая, что simr-1 не является абсолютно необходимым для обеспечения амплификации миРНК на всех piРНК. гены-мишени, или он действует совместно с другими путями или белками.

3) Увеличение siRNAs у мутанта simr-1 также, по-видимому, менее выражено, чем у мутанта piRNA (фиг. 5C). Точно так же изменения в мРНК (включая мРНК гистонов) могут быть менее серьезными, чем у мутантов piRNA. По моему мнению, это может быть важной детерминантой в объяснении различного фенотипа между мутантами piRNA и simr-1.

Как упоминалось в предыдущем комментарии, мы отредактировали первый абзац Обсуждения, чтобы обсудить разницу в фенотипах между simr-1 и prg-1 и предложить возможные причины этого.

4) В абзаце, который теперь называется «фенотип simr-1 Mrt связан с повышенным уровнем апоптоза зародышевых клеток». Авторы предполагают, что значительное увеличение апоптотических клеток в более позднем поколении у мутанта simr-1 по сравнению с относительным WT коррелирует с бесплодие. Как я уже упоминал в своем первом обзоре, хотя животные дикого типа при 25°C имеют уровни апоптотических клеток, сходные с таковыми у более позднего поколения стерильного мутанта simr-1 при 25°C, тем не менее, они фертильны. Таким образом, количество апоптотических клеток, обнаруженное с помощью этого анализа у мутанта simr-1, не предполагает, что они способствуют стерильности. Для сравнения, мутанты h4K9me (met-2, set-25) демонстрируют 4-кратное увеличение числа апоптотических клеток при 25°C по сравнению с WT (в Zeller et al., 2016, Figure 2B). Поэтому, на мой взгляд, эти данные неубедительны и могут побудить к неправильной интерпретации. Вот почему, если авторы хотят показать этот результат, они должны прокомментировать тот факт, что животные дикого типа с одинаковым количеством апоптотических клеток являются фертильными и что количество апоптотических клеток, обнаруженное у мутанта simr-1, может не способствовать стерильности. .

В этот раздел результатов добавлено дополнительное предложение, чтобы прояснить, что высокие уровни апоптоза не всегда коррелируют со стерильностью.

5) Во введении авторы написали: «Здесь мы идентифицируем белок, необходимый для обеспечения взаимодействия между PRG-1 и piRNAs в P-гранулах с амплификации siRNA в фокусах Mutator». Взаимодействие между этими факторами не было подтверждено Co-IP или другими экспериментами, поэтому утверждение необходимо изменить.

Мы отредактировали это предложение, чтобы не подразумевать прямое физическое взаимодействие между SIMR-1 и этими другими путями.

6) Во введении авторы заявляют, что «эта работа идентифицирует один из первых факторов, которые действуют ниже PRG-1, опосредуя продукцию вторичных siRNAs». Это не точно, потому что к настоящему времени идентифицировано много факторов, участвующих в накоплении piRNA-зависимых малых РНК. Кроме того, представленный результат указывает на то, что simr-1 может прямо или косвенно участвовать в накоплении этих siRNA (см. также комментарий 2).

Мы отредактировали это предложение, чтобы не указывать, что SIMR-1 является первым фактором, отождествляемым с этой ролью.

https://doi.org/10.7554/eLife.56731.sa2

Иммунологическая память на SARS-CoV-2, оцененная в течение 8 месяцев после заражения

Мы благодарим клиническое ядро ​​LJI, в частности Г. Леви и Б. Швана, за регистрацию здоровых доноров и закупку образцов крови. Мы благодарим К. Модербахера за вклад в анализ данных. Мы также благодарны Mt. Sinai Personalized Virology Initiative за то, что поделились образцами из банков, взятыми у участников исследования с COVID-19.Мы благодарны А. Вайнбергу за направление участников исследования и Персонализированной вирусологической инициативе (Г. Кляйнер, Л. С. Ф. Малдер, М. Саксена, К. Сривастава, К. Глисон, К. М. Бермудес-Гонсалес, К. Бич, К. Руссо, Л. Соминский, Э. Феррери, Р. Чернет, Л. Икер, А. Салимбангон, Д. Юрчишак, Х. Альшаммари, В. Мендес, А. Амоако, С. Фабр, С. Сутхакаран, М. Авада, Э. Хирш, А. Шин) за то, что они поделились сохраненными образцами от участников исследования с COVID-19. Финансирование: Эта работа финансировалась NIH NIAID в рамках наград AI142742 (Совместные центры иммунологии человека) (A.S., S.C.), контракт NIH №. 75N9301

5 (DW, AS), U01 AI141995-03 (AS, PB) и U01 CA260541-01 (DW). Эта работа была дополнительно частично поддержана институциональными фондами LJI, Фондом Джона и Мэри Ту (DS), NIAID в соответствии с премией K08 AI135078 (JMD), UCSD T32s AI007036 и AI007384 Отделом инфекционных заболеваний (SIR, SAR), а также Биллом и Фонд Мелинды Гейтс INV-006133 от Therapeutics Accelerator, Mastercard, Wellcome, частные благотворительные взносы (KMH. , E.O.S., S.C.) и FastGrant от Emergent Ventures в помощь исследованиям COVID-19. Эта работа была частично поддержана контрактом HHSN272201400008C (FK, для создания реагентов) Центров передового опыта NIAID по исследованиям и эпиднадзору за гриппом (CEIRS), контрактом 75N93019C00051 Совместных инновационных центров вакцины против гриппа (CIVIC), фондом JPB (FK, VS), Фонд Коэна (VS, FK) и Open Philanthropy Project (№ 2020-215611; FK, VS), а также другие благотворительные пожертвования.Мы также благодарим всех пациентов с COVID-19 и здоровых людей, которые сделали это исследование возможным благодаря щедрому донорству крови. Вклад авторов: Conceptualization, S.C., A.S., and D.W.; Расследование, JMD, JM, YK, KMH, EDY, CEF, AG, SH и CN; Формальный анализ, JMD, JM, YK, KMH, CEF, SH, BP, DW, AS и SC; Набор пациентов и образцы, SIR, AF, SAR, FK, VS, DMS и DW; Материальные ресурсы, Ф.К., В.С., В.Р., Э.О.С., Д.В., А.С. и С.К.; Data Curation, YK, JMD, JM и SH; Письмо, YK, JMD, JM, SIR, DW, AS и SC; Supervision, D. W., A.S. и S.C., Администрация проекта, A.F. Конкурирующие интересы: A.S. является консультантом компаний Gritstone, Flow Pharma, Merck, Epitogenesis, Gilead и Avalia. SC является консультантом Avalia. Л.Дж.И. подала заявку на патентную защиту различных аспектов Т-клеточного эпитопа и разработки вакцины. Компания Mount Sinai выдала коммерческим организациям лицензии на проведение серологических анализов и подала заявку на патентную защиту серологических анализов.Д.С., Ф.А., В.С., Ф.К. указаны в качестве изобретателей в находящейся на рассмотрении патентной заявке (F.K., VS) и вакцинах против SARS-CoV-2 на основе вируса болезни Ньюкасла (NDV), которые называют F.K. как изобретатель. Все остальные авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов. Наличие данных и материалов: Все данные приведены в дополнительных материалах. Пулы эпитопов, используемые в этой статье, будут доступны для научного сообщества по запросу и при заключении соглашения о передаче материала. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution 4. 0 International (CC BY 4.0), которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии надлежащего цитирования оригинальной работы. Чтобы просмотреть копию этой лицензии, посетите https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/. Эта лицензия не распространяется на рисунки/фотографии/произведения искусства или другой контент, включенный в статью, авторство которого принадлежит третьей стороне; получить разрешение от правообладателя перед использованием такого материала.

Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie

Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности.Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.


Настройка браузера для приема файлов cookie

Существует множество причин, по которым файл cookie не может быть установлен правильно. Ниже приведены наиболее распространенные причины:

  • В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки браузера, чтобы принять файлы cookie, или спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
  • Ваш браузер спрашивает, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались.Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, нажмите кнопку «Назад» и примите файл cookie.
  • Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Попробуйте другой браузер, если вы подозреваете это.
  • Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г., браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы это исправить, установите правильное время и дату на своем компьютере.
  • Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie.Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.

Почему этому сайту требуются файлы cookie?

Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу. Предоставить доступ без файлов cookie потребует от сайта создания нового сеанса для каждой посещаемой вами страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.


Что сохраняется в файле cookie?

Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в файле cookie; никакая другая информация не фиксируется.

Как правило, в файле cookie может храниться только та информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта. Например, сайт не может определить ваше имя электронной почты, если вы не решите ввести его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступ к остальной части вашего компьютера, и только сайт, создавший файл cookie, может его прочитать.

Обзор проекта ORACLES (Наблюдения за аэрозолями над облаками и их взаимодействием): взаимодействие аэрозолей, облаков и радиации в юго-восточной части Атлантического бассейна

Аккерман, А. С., Тун, О.Б., Стивенс, Д.Э., Хеймсфилд, А.Дж., Раманатан, В., и Велтон, Э. Дж.: Уменьшение тропической облачности сажей, Наука, 288, 1042–1047, 2000. 

Акерман, А.С., Киркпатрик, М.П., ​​Стивенс, Д.Э., и Тун, О.Б.: Влияние влажности над слоистыми облаками на непрямое аэрозольное воздействие на климат, Nature, 432, 1014–1017, https: //doi.org/10.1038/nature03174, 2004. 

Адебийи, А. и Зуидема, П.: Роль южноафриканской восточной струи в Модификации аэрозольной и облачной среды Юго-Восточной Атлантики, В.Дж. Рой. Метеор. Соц., 697, 1574–89, https://doi.org/10.1002/qj.2765, 2016. 

Адебийи, А. А. и Зуидема, П.: Низкая чувствительность облачного покрова к Аэрозоли, сжигающие биомассу, и метеорология над Юго-Восточной Атлантикой, J. Climate, 31, 4329–4346, 2018. 

Адебийи А., Зуидема П. и Абель С.: свертка динамики и влаги с наличием коротковолновых поглощающих аэрозолей над юго-восточная Атлантика, Дж. Климат, 28, 1997–2024 гг., https://doi.org/10.1175/JCLI-D-14-00352. 1, 2015 г.

Adebiyi, A.A., Zuidema, P., Chang, I., Burton, S.P., и Cairns, B.: Облака среднего уровня часто встречаются над слоисто-кучевыми облаками юго-восточной Атлантики, Atmos. хим. Phys., 20, 11025–11043, https://doi.org/10.5194/acp-20-11025-2020, 2020. 

Альбрехт, Б. А.: Аэрозоли, микрофизика облаков и частичная облачность, Наука, 245, 1227–1230, 1989. 

Андела, Н., Мортон, Д. К., Гиглио, Л., Чен, Ю., ван дер Верф, Г. Р., Касибхатла, П. С., ДеФрис, Р. С., Коллатц, Г.Л., Хантсон С., Клостер С., Бачелет Д., Форрест М., Ласслоп Г., Ли Ф., Менжон С., Мелтон Дж. Р., Юэ С. и Рандерсон JT: Сокращение площади выжженных территорий в результате деятельности человека, Science, 356, 1356–1362, 2017. 

Аннегарн, Х. Дж. и Своп, Р. Дж.: SAFARI 2000: Южноафриканский пример Научная дипломатия, Наука и дипломатия, 1, 4, 2012. 

Беннарц, Р. и Рауш, Дж.: Глобальные и региональные оценки количества капель теплых облаков на основе 13-летних наблюдений AQUA-MODIS, Atmos. хим. Phys., 17, 9815–9836, https://doi.org/10.5194/acp-17-9815-2017, 2017. 

Беттс, А.К. и Риджуэй, В.: Связь радиационного, конвективного и Поверхностные потоки над экваториальной частью Тихого океана, J. ​​Atmos. Sci., 45, 522–36, https://doi.org/10.1175/1520-0469(1988)045%3C0522:COTRCA%3E2.0.CO;2, 1988. 

Bond, TC, Doherty, SJ , Фэйи, Д.У., Форстер, П.М., Бернтсен, Т., ДеАнджело, Б.Дж., Фланнер, М.Г., Ган, С., Керхер, Б., Кох, Д., Кинне, С., Кондо, Ю., Куинн, П.К., Сарофим, М.С., Шульц, М.Г., Шульц, М., Венкатараман, К., Чжан, Х., Чжан С., Беллоуэн, Н., Гуттикунда, С.К., Хопке, П.К., Якобсон, М.З., Кайзер, Дж.В., Климонт , Z., Lohmann, U., Schwarz, JP, Shindell, D., Storelvmo, T., Warren, SG, and Zender, CS: Ограничение роли черного углерода в климате. система: Научная оценка, Ж. Геофиз. рез.-атмосфер., 118, 5380–5552, https://doi.org/10.1002/jgrd.50171, 2013. 

Бони, С. и Дюфресн, Дж. Л.: Облака морского пограничного слоя в центре Неопределенности обратной связи тропических облаков в климатических моделях // Геофиз. Рез. Lett., 32, L20806, https://doi.org/10.1029/2005GL023851, 2005. 

Burton, S., Hostetler, C., Cook, A., Hair, J., Seaman, S., Scola, С., Харпер Д., Смит Дж., Фенн М., Ферраре Р., Сайде П.Е., Чемякин Е.В. и Мюллер Д.: Калибровка лидар с высоким спектральным разрешением с использованием интерферометра Майкельсона с данными примеры из ORACLES, Appl. Оптики, 57, 6061, https://doi.org/10.1364/AO.57.006061, 2018. 

Чанд Д., Вуд Р., Андерсон Т., Сатиш С. К. и Чарлсон Р.Дж.: Спутниковое прямое радиационное воздействие аэрозолей, зависящее от облачности обложка, нат. Geosci., 2, 181–184, 2009. 

Чатфилд, Р. Б., Го, З., Сакс, Г. В., Блейк, Д. Р., и Блейк, Н. Дж.: Субтропический глобальный шлейф в Тихоокеанской исследовательской миссии-Тропики А (PEM-Тропики A), PEM-Тропики B и Глобальная программа отбора проб атмосферы (GASP): Как тропические выбросы влияют на отдаленный Тихий океан, J. Geophys. Рез., 107, 4278, https://doi.org/10.1029/2001JD000497, 2002. 

Кокли, Дж. и Чилек, П.: Двухпотоковое приближение в радиационном перенос в т.ч. по углу падающего излучения, Дж. Атмос. наук, 32, 409–418, 1975. 

Cochrane, SP, Schmidt, KS, Chen, H., Pilewskie, P., Kittelman, S., Redemann, J., LeBlanc, S., Pistone, K., Kacenelenbogen, M. , Сигал Розенхаймер М., Шинозука Ю., Флинн К., Платник С., Мейер К., Ферраре Р., Бертон С., Хостетлер К., Хауэлл С., Фрайтаг С. ., Добрацки А. и Доэрти С.: Радиационные эффекты надоблачного аэрозоля на основе авиационных экспериментов ORACLES 2016 и ORACLES 2017, Atmos.Изм. Tech., 12, 6505–6528, https://doi.org/10.5194/amt-12-6505-2019, 2019. 

Coddington, OM, Pilewskie, P., Redemann, J., Platnick, S., Рассел, СПБ, Шмидт К.С., Гор В.Дж., Ливингстон Дж., Винд Г. и Вукичевич Т.: Изучение влияния вышележащих аэрозолей на получение оптических данных облаков. свойства пассивного дистанционного зондирования, J. Geophys. Рез., 115, Д10211, https://doi.org/10.1029/2009JD012829, 2010. 

Костантино, Л. и Бреон, Ф.-М. : Спутниковая оценка прямого радиационного воздействия аэрозолей над Юго-Восточной Атлантикой, Атмос.хим. физ. Discuss., 13, 23295–23324, https://doi.org/10.5194/acpd-13-23295-2013, 2013. 

Дас, С., Харшвардхан, Х., Биан, Х., Чин, М. , Курчи Г., Протонотариу А. П. Т., Миелонен К., Чжан Х., Ван Х. и Лю Х.: Аэрозоль для сжигания биомассы транспорт и вертикальное распределение по южноафриканско-атлантическому региону, Дж. Геофиз. Res.-Atmos., 122, 6391–6415, https://doi.org/10.1002/2016JD026421, 2017. 

Davies, NW, Fox, C., Szpek, K., Cotterell, MI, Taylor, JW, Аллан, Дж.Д., Уильямс П.И., Трембат Дж., Хейвуд Дж.М. и Лэнгридж Дж.М.: Оценка систематических ошибок в измерениях аэрозольного поглощения на основе фильтров с использованием фотоакустической спектроскопии, Atmos. Изм. Tech., 12, 3417–3434, https://doi.org/10.5194/amt-12-3417-2019, 2019. 

Deaconu, LT, Waquet, F., Josset, D., Ferlay, N., Пирс Ф., Тьеле Ф., Дюко Ф., Паскаль Н., Танре Д., Пелон Дж. и Голуб П.: Характеристика консистенции аэрозолей над облаками на основе активных и пассивных измерений A-Train , Атмос. Изм. Tech., 10, 3499–3523, https://doi.org/10.5194/amt-10-3499-2017, 2017. 

Deaconu, LT, Ferlay, N., Waquet, F., Peers, F., Thieuleux, F., и Goloub, P.: Спутниковый вывод о совместном воздействии водяного пара и надоблачного аэрозоля на радиационный баланс и процессы в верхней части облаков в юго-восточной части Атлантического океана, Atmos. хим. Phys., 19, 11613–11634, https://doi.org/10.5194/acp-19-11613-2019, 2019. 

De Graaf, M., Bellouin, N., Tilstra, LG, Haywood, J. и Стаммес, П.: Аэрозольное прямое радиационное воздействие дыма над облаками над юго-востоком Атлантический океан с 2006 по 2009 г. // Геофиз. Рез. Летт., 41, 7723–7730, https://doi.org/10.1002/2014GL061103, 2014. 

Даймонд, М.С., Добрацки, А., Фрайтаг, С., Смолл Грисволд, Д.Д., Хейккила, А., Хауэлл, С.Г., Какараб, М.Е., Подольске, JR, Saide, PE, и Wood, R.: Унос дыма в зависимости от времени представляет собой проблему наблюдений для оценки взаимодействия аэрозолей и облаков над юго-восточной частью Атлантического океана, Atmos. хим. Phys., 18, 14623–14636, https://doi.org/10.5194/acp-18-14623-2018, 2018. 

Доэрти, С.Дж., Сайде, П., Зуидема, П., Шинозука, Ю., Феррада, Г., Маллет, М., Мейер, К., Пайнемаль, Д., Хауэлл, С.Г., Фрайтаг, С., Смирнов, Н., Добрацки А., Подольске Дж., Ферраре Р., Бертон С., Набат П., Вуд Р. и Редеманн Дж.: Смоделированные и наблюдаемые свойства аэрозолей и облаков с вертикальным разрешением прямому аэрозольному радиационному воздействию в Юго-Восточной Атлантике, готовится, 2021 г. 

Дубовик, О.и Кинг, М. Д.: Гибкий алгоритм инверсии для поиска оптических свойств аэрозолей по измерениям яркости солнца и неба, Дж. Геофиз. Res., 105, 20673–20696, 2000. 

Дзамбо, А. М., Л’Экюйер, Т., Си, О. О., и Танелли, С.: Наблюдаемые Структура и характеристики осадков Юго-Восточной Атлантики Слоисто-кучевые облака с бортового радара во время ORACLES 2016-17, J. Appl. метеорол. Clim., 58, 2197–2215, https://doi.org/10.1175/jamc-d-19-0032.1, 2019. 

Дзамбо, А. М., Л’Экюйер, Т. , Синклер К., ван Диденховен Б., Гупта С., Макфаркуар Г., О’Брайен Дж. Р., Кэрнс Б., Василевски А. П. и Александров М.: Совместный путь облачной воды и дождевой воды Поиск путей из наблюдений ORACLES, Atmos. хим. физ. Обсудить., https://doi.org/10.5194/acp-2020-849, в обзоре, 2020 г. 

Истман, Р. и Вуд, Р.К.Т. планетарный пограничный слой: климатология и лагранжева эволюция, Дж. Атмос. наук, 74, 2633–2656, https://doi.org/10.1175/JAS-D-16-0336.1, 2017. 

Эк, Т.Ф., Холбен, Б.Н., Рейд, Дж.С., Мукелабай, М.М., Пикет, С.Дж., Торрес, О., Джетва, Х.Т., Хайер, Э.Дж., Уорд, Д.Э. , Дубовик О., Синюк А., Шафер Дж.С., Джайлз Д.М., Сорокин М., Смирнов А. и Слуцкер И.: Сезонный тренд альбедо однократного рассеяния в южных Частицы, сжигающие африканскую биомассу: последствия для спутниковой продукции и оценки выбросов для крупнейшего в мире источника сжигания биомассы, J. Геофиз. Рез. Atmos., 118, 6414–6432, https://doi.org/10.1002/jgrd.50500, 2013. 

ЕЦСПП: Описание прогнозов и системы прогнозирования ЕЦСПП, Статья в информационном бюллетене, ЕЦСПП, доступна по адресу: https://www. ecmwf.int/sites/default/files/elibrary/2012/17412-describing-ecmwfs-forecasts-and-forecasting-system.pdf (последний доступ: декабрь 2013 г.), 2012. 

Фишман Дж., Хоэлл Дж. М., Бендура Р. Д., Макнил Р. Дж. и Кирхгоф В. WJH: NASA GTE TRACE-A Experiment (сентябрь – октябрь 1992 г.), Обзор, Дж. Геофиз. рез., 101, 23865–23880, 1996.

Форменти, П., Д’Анна, Б., Фламан, К., Малле, М., Пикет, С.Дж., Щепански, К., Ваке, Ф., Ориоль, Ф., Бронье, Г., Бернет, Ф., Шабуро, Ж., Шовинье, А., Шазетт, П., Денжан, К., Дебёф, К., Дуссен, Ж., Эльгинди, Н., Фейерштейн, С., Гаэтани, М., Джорио, К., Клоппер Д., Маллет, М.Д., Набат П., Моно А., Солмон Ф., Намвунде А., Чиквилилва К., Муши Р., Велтон Э.Дж. и Холбен Б. .: Аэрозоли, радиация и облака в Южной Африке Полевая кампания в Намибии: обзор, иллюстративные наблюдения и способ вперед, Б.Являюсь. Метеор. Soc., 100, 1277–1298, https://doi.org/10.1175/BAMS-D-17-0278.1, 2019. 

Grell, GA, Peckham, SE, Schmitz, R., McKeen, SA, Frost, Г., Скамарок, В. К. и Эдер Б.: Полностью связанная «онлайн» химия в рамках модели WRF, Atmos. Environ., 39, 6957–6975, https://doi.org/10.1016/j.atmosenv.2005.04.027, 2005. Поэлло, М.Р., Добрацкий, А., Подольске, Дж.Р., Редеманн, Дж., ЛеБлан, С.Е., Сегал-Розенхаймер, М.и Пистоне К.: Влияние изменчивости вертикального разделения между сжигающими биомассу аэрозолями и морскими слоисто-кучевыми облаками на микрофизические свойства облаков над Юго-Восточной Атлантикой, Atmos. хим. физ. Обсуждать. [препринт], https://doi.org/10.5194/acp-2020-1039, в обзоре, 2020 г. 

Haynes, JM, L’Ecuyer, TS, Stephens, GL, Miller, SD, Mitrescu, C., Вуд, Н.Б., и Танелли, С.: Сбор данных об осадках над океаном с помощью космического радара W-диапазона, J. ​​Geophys. Рез., 114, D00A22, https://doi.org/10.1029/2008JD009973, 2009. 

Хейвуд Дж., Фрэнсис П., Дубовик О., Глю М. и Холбен Б.: Сравнение распределения аэрозолей по размерам, радиационных свойств и оптических толщин определено наблюдениями с самолетов и солнечными фотометрами во время SAFARI 2000, Дж. Геофиз. Рез., 108, 8471, https://doi.org/10.1029/2002JD002250, 2003. 

Хейвуд, Дж. М., Осборн, С. Р., и Абель, С. Дж.: Эффект наложения поглощающие аэрозольные слои при удалении данных об облачности с помощью дистанционного зондирования радиус и оптическая толщина облака, Q.Дж. Рой. Метеор. Soc., 130, 779–800, 2004. 

Haywood, JM, Abel, SJ, Barrett, PA, Bellouin, N., Blyth, A., Bower, KN, Brooks, M., Carslaw, K., Che , Х., Коу, Х., Коттерелл, М.И., Кроуфорд, И., Куи, З., Дэвис, Н., Дингли, Б., Филд, П., Форменти, П., Гордон, Х., де Грааф М., Герберт Р., Джонсон Б., Джонс А. С., Лэнгридж Дж. М., Малавель Ф., Партридж Д. Г., Пирс Ф., Редеманн Дж., Штир П., Шпек К. , Taylor, JW, Watson-Parris, D., Wood, R., Wu, H., and Zuidema, P.: Обзор: кампания по измерению взаимодействия и воздействия облаков, аэрозолей и излучения: год-2017 (CLARIFY-2017), Atmos. хим. физ. Обсудить., https://doi.org/10.5194/acp-2020-729, в обзоре, 2020 г. 

Герман, Дж., Седе, А., Спиней, Э., Маунт, Г. , Цорциу, М. , и Абухасан, N.: NO 2 количества колонок с наземных спектрометров Pandora и MFDOAS с использованием метода DOAS прямого солнца: взаимные сравнения и применение к OMIvalidation, J. Geophys. Рез., 114, D13307, https://doi.org/10.1029/2009JD011848, 2009. 

Герман, Дж., Эванс, Р., Седе, А., Абухассан, Н., Петропавловских, И., и МакКонвилл, Г.: Сравнение извлечений озона из спектрометрической системы Pandora и спектрофотометр Добсона в Боулдере, Колорадо, Атмос. Изм. Тех., 8, 3407–3418, https://doi.org/10.5194/amt-8-3407-2015, 2015. 

Холбен Б. Н., Экк Т. Ф., Слуцкер И., Танре Д., Буйс Дж. П., Сетцер А., Вермоте Э., Рейган Дж. А., Кауфман Ю., Накадзима Т., Лавеню Ф., Янковяк, И., и Смирнов, А.: AERONET – федеративная инструментальная сеть и архив данных для характеристики аэрозолей, Remote Sens. Environ., 66, 1–16, 1998. 

Холбен Б.Н., Ким Дж., Сано И., Мукаи С., Экк Т.Ф., Джайлз Д.М., Шафер Дж.С., Синюк А., Слуцкер И., Смирнов А., Сорокин М. , Андерсон Б.Е., Че Х., Чой М., Кроуфорд Дж.Х., Ферраре Р.А., Гарай М.Дж., Чон У., Ким М., Ким В., Нокс Н., Ли З., Лим Х.С., Лю Ю., Марининг Х., Наката М., Пикеринг К.Е., Пикет С., Редеманн Дж., Рейд Дж. С., Салинас С., Сео С., Тан Ф., Трипати С. Н., Тун О. Б. и Сяо К.: Обзор мезомасштабных аэрозольных процессов, сравнения и проверка исследования сетей DRAGON, Atmos. хим. Phys., 18, 655–671, https://doi.org/10.5194/acp-18-655-2018, 2018. 

Хаффман, Г.Дж., Адлер, Р.Ф., Болвин, Д.Т., Гу, Г., Нелкин, Э.Дж., Боуман, К.П., Хонг, Ю., Стокер, Э.Ф., Вольф, Д.Б.: Многоспутниковые осадки TRMM Анализ: квазиглобальные, многолетние оценки осадков с помощью комбинированных датчиков в Fine Scale, Дж.Гидрометеор., 8, 38–55, 2007. 

МГЭИК: Изменение климата, 2013 г.: Основы физических наук. Вклад Рабочая группа I к Пятому оценочному докладу Межправительственной Панель по изменению климата, под редакцией: Стокер, Т. Ф., Цинь, Д., Платтнер, Г.-К., Тигнор, М., Аллен С.К., Бошунг Дж., Науэльс А. , Ся Ю., Бекс В. и Мидгли П. М., издательство Кембриджского университета, Кембридж, Великобритания и Нью-Йорк. York, USA, 2013. 

Джетва Х., Торрес О., Ваке Ф., Чанд Д. и Ху Ю.: Как сравнивают датчики при определении оптической толщины надоблачного аэрозоля? Оценка на основе тематического исследования, Geophys.Рез. Письма, 41, 186–192, https://doi.org/10.1002/2013GL058405, 2014. 

Джетва, Х., Торрес, О., Ремер, Л., Редеманн, Дж., Ливингстон, Дж., Дунаган, С., Шинозука, Ю. , Касенеленбоген, М., Розенхаймер, М.С., и Спурр, Р.: Проверка оптической толщины надоблачного аэрозоля MODIS, полученная с помощью алгоритма «соотношения цветов» с использованием прямых измерений, сделанных бортовыми датчиками НАСА AATS и 4STAR, Atmos. Изм. Tech., 9, 5053–5062, https://doi.org/10.5194/amt-9-5053-2016, 2016. 

Jethva, H., Торрес, О., и Ан, К.: 12-летняя глобальная запись оптической толщины поглощающих аэрозолей над облаками, полученная с помощью алгоритма OMI/OMACA, Atmos. Изм. Tech. , 11, 5837–5864, https://doi.org/10.5194/amt-11-5837-2018, 2018. 

Какараб, М., Торнхилл, К.Л., Добрацки, А., Хауэлл, С.Г., О. ‘Брайен, Дж. Р., Фрейтаг, С., Поэлло, М. Р., Вуд, Р., Зуидема, П., Редеманн, Дж., и Ненес, А.: Аэрозоль, сжигающий биомассу, как модулятор количества капель в юго-восточной части Атлантического региона. , Атмос.хим. Phys., 20, 3029–3040, https://doi.org/10.5194/acp-20-3029-2020, 2020. 

Kacenelenbogen, MS, Vaughan, MA, Redemann, J., Young, SA, Liu, Z., Hu, Y., Omar, AH, LeBlanc, S., Shinozuka, Y., Livingston, J., Zhang, Q., and Powell, KA: Оценки глобального коротковолнового прямого радиационного воздействия аэрозолей над непрозрачными водяными облаками с использованием комбинация спутниковых датчиков A-Train, Atmos. хим. Phys., 19, 4933–4962, https://doi.org/10.5194/acp-19-4933-2019, 2019. 

Katich, J.М., Самсет Б.Х., Буй Т.П., Долльнер М., Фройд К.Д., Кампузано-Йост, П., Нолт, Б. А., Шредер, Дж. К., Вайнцирль, Б., и Шварц, Дж. П.: Сильный контраст в удаленном черном углеродном аэрозоле нагрузки между Атлантическим и Тихоокеанским бассейнами // J. Geophys. Рез.-Атм., 123, 13386–13395, https://doi.org/10.1029/2018JD029206, 2018. 

Кейл, А. и Хейвуд, Дж. М.: Солнечное радиационное воздействие аэрозоля BB частиц во время SAFARI 2000: Тематическое исследование, основанное на измерении аэрозоля и свойства облаков, Дж.Геофиз. Рез., 108, 8467, г. https://doi.org/10.1029/2002JD002315, 2003. 

Knobelspiesse, K., Cairns, B., Jethva, H., Kacenelenbogen, M., Segal-Rosenheimer, M., and Torres, O.: Remote обнаружение надоблачных аэрозолей, в: Light Scattering Reviews 9, под редакцией: Кохановский, А., Springer Praxis Books, Springer, Berlin, Heidelberg, https://doi.org/10.1007/978-3-642-37985-7_5 , 2015. 

Кох, Д. и Дель Дженио, А.Д.: Полупрямое воздействие черного углерода на облачный покров: обзор и синтез, Atmos.хим. Phys., 10, 7685–7696, https://doi.org/10.5194/acp-10-7685-2010, 2010. 

Коффи, Б., Шульц, М., Бреон, Ф., Грисфеллер, Дж. , Винкер Д., Балкански Ю., Бауэр С., Бернтсен Т., Чин М., Коллинз В.Д., Дентенер Ф. , Диль Т., Истер Р., Ган С., Жину, П., Гонг, С., Горовиц, Л.В., Иверсен, Т., Киркевог, А., Кох, Д., Крол, М., Мире, Г., Штир, П., и Такемура, Т.: Применение продукта слоя CALIOP для оценки вертикальное распределение аэрозолей по глобальным моделям: фаза AeroCom I результаты, Дж.Геофиз. Res., 117, D10201, https://doi.org/10.1029/2011JD016858, 2012. 

LeBlanc, S.: Moving Lines: исследовательский полет НАСА в воздухе выпуск инструмента планирования (версия v1.21), Zenodo, https://doi.org/10.5281/zenodo.1478126, 2018 г. 

LeBlanc, SE, Redemann, J., Flynn, C., Pistone, K., Kacenelenbogen М., Сегал-Розенхаймер М., Шинозука Ю., Дунаган С., Дальгрен Р.П., Мейер К., Подольске Дж., Хауэлл С.Г., Фрайтаг С., Смолл-Грисволд Дж. , Холбен Б., Даймонд М., Вуд Р., Форменти П., Пикет С., Мэггс-Келлинг Г., Гербер М. и Намвунде А.: Оптическая толщина надоблачного аэрозоля по данным воздушных наблюдений в юго-восточной Атлантике, Atmos. хим. Phys., 20, 1565–1590, https://doi.org/10.5194/acp-20-1565-2020, 2020.

млн лет, P.-L., Rasch, PJ, Fast, JD, Easter, RC , Густафсон-младший, В.И., Лю, X., Ган, С.Дж., и Сингх, Б.: Оценка физического пакета CAM5 в модели WRF-Chem: реализация, чувствительность к разрешению и первая оценка для регионального тематического исследования, Geosci .Model Dev., 7, 755–778, https://doi.org/10.5194/gmd-7-755-2014, 2014. 

Маллет, М., Набат, П., Зуидема, П., Редеманн, Дж. ., Сайер А.М., Стенгель М., Шмидт С., Кокрейн С., Бертон С., Ферраре Р., Мейер К., Сайде П., Джетва Х., Торрес О. , Вуд Р., Сен-Мартен Д., Рериг Р., Хсу К. и Форменти П.: Моделирование переноса, вертикального распределения, оптических свойств и радиационного воздействия дымовых аэрозолей с помощью региональной климатической модели ALADIN в ходе экспериментов ORACLES-2016 и LASIC, Atmos.хим. Phys., 19, 4963–4990, https://doi.org/10.5194/acp-19-4963-2019, 2019. 

Маллет, М., Солмон, Ф., Набат, П., Эльгинди, Н. , Waquet, F., Bouniol, D., Sayer, AM, Meyer, K., Roehrig, R., Michou, M. , Zuidema, P., Flamant, C., Redemann, J., и Formenti, P. : Прямое и полупрямое радиационное воздействие аэрозолей, сжигающих биомассу, над юго-восточной Атлантикой (ЮВА) и его чувствительность к поглощающим свойствам: исследование моделирования регионального климата, Atmos. хим. Phys., 20, 13191–13216, https://doi.org/10.5194/acp-20-13191-2020, 2020. 

Мартин Г.М., Джонсон Д.В. и Спайс А.: Измерение и параметризация эффективного радиуса капель в теплых слоистообразных облаках, J. Atmos. Sci., 51, 1823–1842, 1994. 

Могер, Г. и Норрис, Дж.: Метеорологическая погрешность в спутниковых оценках взаимосвязи аэрозолей и облаков // Геофиз. Рез. Летта, 34, https://doi.org/10.1029/2007GL029952, 2007. 

Мейер, К., Платник, С., Ореопулос, Л., и Ли, Д.: Оценка прямого радиационный эффект поглощающих аэрозолей над морским пограничным слоем облака в юго-восточной Атлантике с помощью MODIS и CALIOP, J.Геофиз. Res.-Atmos., 118, 4801–4815, https://doi.org/10.1002/jgrd.50449, 2013.

Мейер, К., Платник, С., и Чжан, З.: Одновременно выводя выше- облако поглощающая оптическая толщина аэрозоля и нижележащее облако жидкой фазы оптические и микрофизические свойства с использованием MODIS, J. Geophys. рез.-атмосфер., 120, 2015JD023128, https://doi.org/10.1002/2015JD023128, 2015. 

Майлз, Н.Л., Верлинде, Дж., и Клотио, Э.Э.: Распределение размеров облачных капель в низкоуровневых слоистообразных облаках, Дж.Атмос. Sci., 57, 295–311, 2000. 

Миллер, Д.Дж., Сегал-Розенхаймер, М., Кнобельшписс, К., Редеманн, Дж., Кэрнс, Б., Александров, М., ван Диденховен, Б., и Василевски, А.: Свойства жидких облаков низкого уровня во время ORACLES, полученные с использованием бортовых поляриметрических измерений и алгоритма нейронной сети, Atmos. Изм. Тех., 13, 3447–3470, https://doi.org/10.5194/amt-13-3447-2020, 2020. 

Миннис П., Нгуен Л., Паликонда Р., Хек П. В., Спангенберг Д. А., Доэллинг Д.Р., Айерс, Дж.К., Смит-младший, В.Л., Хайер, М.М., Трепте, К. З., Авей, Л.А., Чанг, Ф.-Л., Йост, Ч.Р., Чи, Т.Л., и Сан-Мак, С.: Рядом -настоящий восстановление облаков времени из оперативных и исследовательских метеорологических спутники, Proceedings of the SPIE Europe Remote Sens., Кардифф, Великобритания, 15–18 сентябрь 2008 г., 7107-2, 2008 г. 

Миннис, П., Сан-Мак, С., Чен, Ю., Чанг, Ф.-Л., Йост, К.Р., Смит-младший, В.Л., Хек, П.В., Ардуини Р.Ф., Бедка С.Т., Йи Ю., Хонг Г., Джин З., Пайнемаль Д., Паликонда Р., Скарино Б., Спангенберг Д. А., Смит Р. А., Трепте, К.З., Ян, П., и Се, Ю.: Облачный продукт CERES MODIS поиски для издания 4, часть I: изменения алгоритма, IEEE Trans. Geosci. Дистанционный датчик, https://doi.org/10.1109/TGRS.2020.3008866, 2020. 

Молод, А., Такач, Л., Суарес, М., Бакмайстер, Дж., Сонг, И.-С., и Эйхман, А.: Модель общей циркуляции атмосферы GEOS-5: средний климат и развитие от MERRA до Fortuna, Серия технических отчетов о глобальном Моделирование и усвоение данных, НАСА, Вашингтон, Д.C., USA, 28, 124 стр. , 2012. 

Myhre, G., Samset, BH, Schulz, M., Balkanski, Y., Bauer, S., Berntsen, TK, Bian, H., Bellouin, Н., Чин, М., Дил, Т., Истер, Р.С., Файхтер, Дж., Ган, С.Дж., Хауглустейн, Д., Иверсен, Т., Кинне, С., Киркевог, А., Ламарк, Дж. -Ф., Лин, Г., Лю, X., Лунд, М.Т., Луо, Г., Ма, X., ван Нойе, Т., Пеннер, Дж.Э., Раш, П.Дж., Руис, А., Селанд, О. ., Ски Р.Б., Стиер П., Такемура Т., Цигаридис К., Ван П., Ван З., Сюй Л., Ю, Х., Ю Ф., Юн Дж.-Х., Чжан К., Чжан Х. и Чжоу К.: Радиационное воздействие прямого аэрозольного эффекта на основе моделирования AeroCom Phase II, Atmos. хим. Phys., 13, 1853–1877, https://doi.org/10.5194/acp-13-1853-2013, 2013. 

Национальные академии наук, инженерии и медицины: процветание Меняющаяся планета: десятилетняя стратегия наблюдения Земли из космоса, Издательство национальных академий, Вашингтон, округ Колумбия, США, https://doi.org/10.17226/24938, 2018. 

Николлс, С. и Лейтон, Дж.: Наблюдательное исследование структуры пластов слоистых облаков, Часть I: Структура, Q. Дж. Рой. Метеор. Soc., 112, 431–460, 1986. 

Научная группа ORACLES: Получен набор данных об аэрозолях, облаках и связанных с ними данных На борту P3 во время ORACLES 2018, версия 2, проект NASA Ames Earth Science Project Офис, https://doi.org/10.5067/Suborbital/ORACLES/P3/2018_V2, 2020a.

Научная группа ORACLES: Получен набор данных об аэрозолях, облаках и связанных с ними данных На борту P3 во время ORACLES 2017, версия 2, проект NASA Ames Earth Science Project Офис, https://doi.org/10.5067/Suborbital/ORACLES/P3/2017_V2, 2020b.

Научная группа ORACLES: Получен набор данных об аэрозолях, облаках и связанных с ними данных На борту P3 во время ORACLES 2016, версия 2, проект NASA Ames Earth Science Project Офис, https://doi.org/10.5067/Suborbital/ORACLES/P3/2016_V2, 2020c.

Научная группа ORACLES: Получен набор данных об аэрозолях, облаках и связанных с ними данных На борту ER2 во время ORACLES 2016, версия 2, проект NASA Ames Earth Science Project Офис, https://doi. org/10.5067/Suborbital/ORACLES/ER2/2016_V2, 2020d.

Пайнемаль, Д. и Зуидема, П.: Микрофизическая изменчивость слоисто-кучевых облаков юго-восточной части Тихого океана: синоптические условия и радиационный отклик, Atmos. хим. Phys., 10, 6255–6269, https://doi.org/10.5194/acp-10-6255-2010, 2010. 

Painemal, D. and Zuidema, P.: Оценка эффективного радиуса облака MODIS и восстановление оптической толщины над юго-восточной частью Тихого океана с помощью VOCALS-REx in situ измерения, J. Geophys. Рез., 116, Д24206, https://doi.org/10.1029/2011JD016155, 2011. 

Паппенбергер Ф., Шипал К.и Буизза, Р.: Гидрологические аспекты метеорологическая проверка, Atmospheric Sci. Lett., 9, 43–52, 2008. 

Пирс, Ф., Фрэнсис, П., Фокс, К., Абель, С.Дж., Шпек, К., Коттерелл, М.И., Дэвис, Н.В., Лэнгридж, Дж.М., Мейер , К.Г., Платник, С.Е. и Хейвуд, Дж.М.: Наблюдение за поглощающими аэрозолями над облаками над юго-восточной частью Атлантического океана с геостационарного спутника SEVIRI – Часть 1: Описание метода и чувствительность, Атмос. хим. Phys., 19, 9595–9611, https://doi.org/10.5194/acp-19-9595-2019, 2019. 

Пистоне К., Редеманн Дж., Доэрти С., Зуидема П., Бертон С., Кэрнс Б., Кокрейн С., Ферраре , Р., Флинн, К., Фрайтаг, С., Хауэлл, С.Г., Касенеленбоген, М., ЛеБлан, С., Лю, X., Шмидт, К.С., Седлачек III, А.Дж., Сегал-Розенхаймер, М., Шинозука , Ю., Стамнес, С., ван Диденховен, Б., Ван Хартен, Г., и Сюй, Ф.: Взаимное сравнение оптических свойств аэрозоля горения биомассы, полученных на месте и с помощью инструментов дистанционного зондирования в ORACLES-2016, Atmos. хим. физ., 19, 9181–9208, https://doi.org/10.5194/acp-19-9181-2019, 2019. 

Rajapakshe, C., Zhang, Z., Yorks, JE, Yu, H., Tan, К., Мейер К., Платник С. и Винкер Д. М.: Сезонно переносимые аэрозольные слои над юго-восток Атлантики ближе к нижележащим облакам, чем сообщалось ранее, Геофиз. Рез. Lett., 44, 5818–5825, https://doi.org/10.1002/2017GL073559, 2017. 

Ran, Q., Fu, W., Liu, Y., Li, T. Shi, K., и Сивакумар, Б.: Оценка Количественные прогнозы осадков от ECMWF, CMA и UKMO для наводнений Прогнозирование: приложение к двум бассейнам в Китае, Nat. Опасности Рев., 19, 05018003, https://doi.org/10.1061/(ASCE)NH.1527-6996.0000282, 2018. 

Rouault, M.: Двухгодичное вторжение тропических вод в северную Бенгелу апвеллинг, Геофиз. Рез. Lett., 39, L12606, https://doi.org/10.1029/GL052099, 2012. 

Saide, P.E., Thompson, G., Eidhammer, T., da Silva, A.M., Pierce, R.B., и Кармайкл, Г. Р.: Оценка влияния дыма от сжигания биомассы на экологические условия для многолетних вспышек торнадо путем объединения микрофизика с учетом аэрозолей и ограничения на выбросы огня, Дж.Геофиз. Res.-Atmos., 121, 10294–10311, https://doi.org/10.1002/2016JD025056, 2016. 

Сакаеда Н., Вуд Р. и Раш П.Дж.: Прямое и Аэрозоль горения африканской биомассы, J. Geophys. Рез.-Атм., 116, Д12205, https://doi.org/10.1029/2010JD015540, 2011. 

Сайер, А. М., Хсу, Н. К., Беттенхаузен, К., Ли, Дж., Редеманн, Дж., Шмид, Б. и Шинозука Ю.: Расширение зоны поиска аэрозолей «Deep Blue» к случаям поглощения аэрозолей над облаками: анализ чувствительности и первые тематические исследования, Дж. Геофиз. Res.-Atmos., 121, 4830–4854, 2016. 

Sayer, AM, Hsu, NC, Lee, J., Kim, WV, Burton, S., Fenn, MA, Ferrare, RA, Kacenelenbogen, M. , Леблан С., Пистоне К., Редеманн Дж., Сегал-Розенхаймер М., Шинозука Ю. и Цай С.-К.: Два десятилетия наблюдения за дымом над облаками в юго-восточной части Атлантического океана : Обновления и проверка алгоритма Deep Blue с данными полевых кампаний ORACLES, Atmos. Изм. Тех., 12, 3595–3627, https://doi.org/10.5194/amt-12-3595-2019, 2019. 

Шульц, М., Textor, C., Kinne, S., Balkanski, Y., Bauer, S., Berntsen, T., Berglen, T., Boucher, O., Dentener, F., Guibert, S., Isaksen, ISA, Иверсен Т., Кох Д., Киркевог А., Лю Х., Монтанаро В., Мире Г., Пеннер Дж. Э., Питари Г., Редди С., Селанд О., Штир , П., и Такемура, Т.: Радиационное воздействие аэрозолей на основе современных и доиндустриальных моделей AeroCom, Atmos. хим. Phys., 6, 5225–5246, https://doi.org/10.5194/acp-6-5225-2006, 2006. 

Сигал-Розенхаймер, М., Миллер Д., Кнобельсписсе К. , Редеманн Дж., Кэрнс, Б. и Александров М.: Разработка нейросетевого поиска жидкого облака свойства из многоугольных поляриметрических наблюдений, Дж. Квант. Спектроск. Ra., 220, 39–51, 2018. 

Shinozuka, Y. и Redemann, J.: Горизонтальная изменчивость оптической толщины аэрозоля, наблюдаемая во время авиационного эксперимента ARCTAS, Atmos. хим. Phys., 11, 8489–8495, https://doi.org/10.5194/acp-11-8489-2011, 2011. 

Shinozuka, Y., Saide, P.E., Феррада Г.А., Бертон С.П., Ферраре Р., Доэрти С.Дж., Гордон Х., Лонго К., Маллет М., Фэн Ю., Ван К., Ченг Ю., Добрацки, А., Фрайтаг С., Хауэлл С.Г., ЛеБлан С., Флинн С., Сегал-Розенхаймер М., Пистоне К., Подольске Дж. Р., Стит Э. Дж., Беннетт Дж. Р., Кармайкл Г. Р., да Силва А., Говиндараджу Р., Леунг Р., Чжан Ю., Пфистер Л., Рю Ж.-М., Редеманн Дж., Вуд Р. и Зуидема П.: Моделирование задымленной тропосферы юго-восточной Атлантики: сравнение с данными бортовых наблюдений ORACLES за сентябрь 2016 г., Atmos.хим. Phys., 20, 11491–11526, https://doi. org/10.5194/acp-20-11491-2020, 2020. 

Симпсон, Дж. и Виггерт, В.: Модели осаждающихся кучевых башен, Mon. Weather Rev., 97, 471–489, 1969. W. и Powers, JG: A Description of the Advanced Research, WRF, Version 3.27.3-27, Технические примечания NCAR, NCAR/TN-4751STR, доступно по адресу: https://opensky.ucar.edu/islandora/object /technotes:500/datastream/PDF/view (последний доступ: декабрь 2020 г.), 2008 г.

Сорушян А., Фейнгольд Г., Лебсок М. Д., Цзян Х. и Стивенс Г. Л.: О восприимчивости облаков к аэрозольным возмущениям в виде осадков. Геофиз. Рез. Lett., 36, 13, https://doi.org/10.1029/2009GL038993, 2009. 

Stier, P., Schutgens, NAJ, Bellouin, N., Bian, H., Boucher, O., Chin, M. ., Ган, С., Хьюниус, Н., Кинне, С., Лин, Г., Ма, X., Мире, Г., Пеннер, Дж. Э., Рэндлс, К.А., Самсет, Б., Шульц, М., Такемура, Т., Ю, Ф., Ю, Х. и Чжоу, К.: Неопределенности модели хозяина в оценках радиационного воздействия аэрозолей: результаты сравнительного исследования AeroCom Prescribed, Atmos. хим. Phys., 13, 3245–3270, https://doi.org/10.5194/acp-13-3245-2013, 2013. 

Swap, RJ, Annegarn, HJ, Suttles, JT, King, MD, Platnick, S ., Приветт, Дж. Л., и Скоулз, Р. Дж.: Горящая Африка: тематический анализ Южноафриканская региональная научная инициатива (SAFARI 2000), J. Geophys. Res., 108, 8465, https://doi.org/10.1029/2003JD003747, 2003. 

Щедрак, М., Остин, П. Х., и Круммель, П. Б.: Изменчивость оптических Глубина и эффективный радиус морских слоисто-кучевых облаков, Дж.Атмос. наук, 58, 2912–2926, https://doi.org/10.1175/1520-0469(2001)058<2912:VOODAE>2.0.CO;2, 2001. 

Туми, С.: Загрязнение и планетарное альбедо, Атмос. Окружающая, 8, 1251–1256, 1974. 

Цорциу, М., Герман, Дж. Р., Седе, А., и Абухасан, Н.: Высокая точность, абсолютные измерения общего содержания озона в столбе с помощью спектрометра Pandora система: сравнение с данными двойного монохроматора Брюера и АураОМИ, J. Geophys. Рез., 117, D16303, https://doi.org/10.1029/2012JD017814, 2012.

ван дер Верф, Г.Р., Рандерсон, Дж.Т., Гиглио, Л., Коллатц, Г.Дж., Мю, М., Касибхатла, П.С., Мортон, Д.К., ДеФрис, Р.С., Джин, Ю., и ван Левен, Т.Т.: Global выбросы от пожаров и вклад обезлесения, саванны, лесных, сельскохозяйственных и торфяных пожаров (1997–2009 гг.), Atmos. хим. Phys., 10, 11707–11735, https://doi.org/10.5194/acp-10-11707-2010, 2010. 

Уотсон-Пэррис Д., Шутгенс Н., Винкер Д., Бертон С., Ферраре Р., Stier, P.: О пределах CALIOP для ограничения моделируемой свободной тропосферы Аэрозоль, Геофиз.Рез. Lett., 45, 9260–9266, 2018. 

Werdell, P.J., Behrenfeld, M.J., Bontempi, P.S., Boss, E., Cairns, B., Дэвис Г.Т., Франц Б.А., Глизе У.Б., Горман Э.Т., Хасекамп О., Knobelspiesse, K.D., Mannino, A., Martins, J.V., McClain, C.R., Meister, Г. и Ремер, Л. А.: Планктон, аэрозоль, облако, экосистема океана (PACE) миссия: Статус, наука, достижения, Б. Ам. метеорол. Soc., 100, 1775–1794 https://doi.org/10.1175/bams-d-18-0056.1, 2019. 

Wilcox, E.M.: Прямое и полупрямое радиационное воздействие дымовых аэрозолей на облака, Atmos. хим. Phys., 12, 139–149, https://doi.org/10.5194/acp-12-139-2012, 2012. 

Вуд, Р.: Аннулирование косвенного воздействия аэрозолей на морские слоисто-кучевые облака за счет истончения облаков, J. Atmos. Sci., 64, 2657–2669, 2007. 

Вуд, Р.: Слоисто-кучевые облака, пн. Weather Rev., 140, 2373–2423, https://doi.org/10.1175/MWR-D-11-00121.1, 2012. 

Вуд, Р., Леон, Д., Лебсок, М., Снайдер, Дж. ., и Кларк, AD: Осадки влияют на изменчивость концентрации капель в морском климате Облака: ВЫБРОС ОСАДКОВ DROP CONC, Дж.Геофиз. Рез.-Атмос., 117, Д19, https://doi.org/10.1029/2012JD018305, 2012. 

Ву, Х., Тейлор, Дж.В., Шпек, К., Лэнгридж, Дж.М., Уильямс, П.И., Флинн, М., Аллан, Дж.Д., Абель, С.Дж., Питт, Дж., Коттерелл, М.И., Фокс, К., Дэвис, Н.В., Хейвуд, Дж., и Коу, Х.: Вертикальная изменчивость свойств сильно состарившегося горящего аэрозоля биомассы, переносимого над юго-восточной Атлантикой во время CLARIFY-2017, Atmos. хим. Phys., 20, 12697–12719, https://doi.org/10. 5194/acp-20-12697-2020, 2020.

Сюй Ф., ван Хартен Г., Дайнер Д., Дэвис А., Зайдель Ф., Рейнганс Б., Тоска М., Александров М., Кэрнс Б., Ферраре Р., Бертон С., Фенн М. А., Хостетлер С. А., Вуд Р. и Редеманн Дж.: Совместное восстановление свойств облака жидкой воды и надоблачного аэрозоля с помощью бортового многоугольного спектрополяриметрического сканера изображений (AirMSPI), Дж. Геофиз. рез.-атмосфер., 123, 3175–3204, 2018. 

Йе, Дж., Хе, Ю., Паппенбергер, Ф., Клоук, Х.Л., Манфул, Д.Ю., и Ли, З.: Оценка среднесрочных ансамблевых прогнозов осадков ЕЦСПП для речные бассейны, кв.Дж. Р. Метеор. Soc., 140, 1615–1628, 2014. 

Ю, Х. и Чжан, З.: Новые направления: Новые спутниковые наблюдения за надоблачные аэрозоли и прямое радиационное воздействие, Атмос. Окружающая среда., 72, 36–40, 2013. 

Ю, Х., Чжан, Ю., Чин, М., Лю, З., Омар, А., Ремер, Л. А., Ян, Ю., Юань, Т. и Чжан Дж.: Комплексный анализ аэрозоля над облаками из Мультисенсорные измерения A-Train, Rem. Sens. Environ., 121, 125–131, https://doi.org/10.1016/j.rse.2012.01.011, 2012. 

Чжан, Дж.и Зуидема, П.: Суточный цикл задымленного морского пограничного слоя, наблюдаемый в августе в удаленной юго-восточной Атлантике, Атмос. хим. Phys., 19, 14493–14516, https://doi.org/10.5194/acp-19-14493-2019, 2019. 

Чжан З., Мейер К., Ю Х., Платник С. , Коларко П., Лю З. и Ореопулос Л.: Коротковолновое прямое радиационное воздействие надоблачных аэрозолей на глобальные океаны, полученное на основе 8-летних наблюдений CALIOP и MODIS, Atmos. хим. Phys., 16, 2877–2900, https://doi.org/10.5194/acp-16-2877-2016, 2016. 

Zuidema, P., Painemal, D., deSzoeke, S., and Fairall, C.: Слоисто-кучевое облако оценки максимальной высоты и их последствия для климата, J. ​​Climate, 22, 4652–4666, https://doi.org/10.1175/2009JCLI2708.1, 2009. 

Zuidema, P., Chiu, C., Fairall, C.W., Ghan, S.J., Kollias, P., McFarguhar, Г. М., Мехем Д. Б., Ромпс Д. М., Вонг Х., Ютер С. Э., Альварадо М. Дж. , ДеЗоке С.П., Фейнгольд Г., Хейвуд, Дж. М., Льюис, Э. Р., Маккомиски, А., Редеманн, Дж., Тернер, Д. Д., Вуд, Р., и Чжу, П.: Слоистый атлантический дым. Научный план взаимодействия с облаками (LASIC), DOE/SC-ARM-14-037, доступен по адресу: http://www.osti.gov/scitech/servlets/purl/1232658 (последний доступ: декабрь 2018 г.), 2015 г.

Зуидема П., Редеманн Дж., Хейвуд Дж., Вуд Р., Пикет С., Хипондока М. и Форменти, П.: Дым и облака над Юго-Восточной Атлантикой: предстоящее поле Кампании исследуют влияние поглощающих аэрозолей на климат, Б. Являюсь. метеорол. Soc., 97, 1131–1135, https://doi.org/10.1175/BAMS-D-15-00082.1, 2016. 

Зуидема П., Седлачек III А. Дж., Флинн К., Спрингстон С., Дельгадилло Р., Чжан, Дж., Айкен, А.С., Кунц, А., и Мурадян, П.: Пограничный слой острова Вознесения в удаленной юго-восточная Атлантика часто задымлена, Geophys. Рез. Летта, 45, 4456–4465, https://doi.org/10.1002/2017GL076926, 2018 г. 

SEC.gov | Порог частоты запросов превысил

Чтобы обеспечить равный доступ для всех пользователей, SEC оставляет за собой право ограничивать запросы, исходящие от необъявленных автоматических инструментов. Ваш запрос был идентифицирован как часть сети автоматизированных инструментов, выходящих за рамки приемлемой политики, и будет управляться до тех пор, пока не будут предприняты действия по объявлению вашего трафика.

Пожалуйста, заявите о своем трафике, обновив свой пользовательский агент, включив в него информацию о компании.

Чтобы ознакомиться с рекомендациями по эффективной загрузке информации с SEC.gov, включая последние документы EDGAR, посетите сайт sec.gov/developer. Вы также можете подписаться на рассылку обновлений по электронной почте в программе открытых данных SEC, включая передовые методы, которые делают загрузку данных более эффективной, и SEC.gov, которые могут повлиять на процессы загрузки по сценарию. Для получения дополнительной информации обращайтесь по адресу [email protected]

Для получения дополнительной информации см. Политику конфиденциальности и безопасности веб-сайта SEC. Благодарим вас за интерес, проявленный к Комиссии по ценным бумагам и биржам США.

Идентификатор ссылки: 0.5dfd733e.1645722833.106d88a6

Дополнительная информация

Политика безопасности Интернета

Используя этот сайт, вы соглашаетесь на мониторинг и аудит безопасности.В целях безопасности и для обеспечения того, чтобы общедоступные услуги оставались доступными для пользователей, эта правительственная компьютерная система использует программы для мониторинга сетевого трафика для выявления несанкционированных попыток загрузить или изменить информацию или иным образом нанести ущерб, включая попытки отказать в обслуживании пользователям.

Несанкционированные попытки загрузки информации и/или изменения информации в любой части этого сайта строго запрещены и подлежат судебному преследованию в соответствии с Законом о компьютерном мошенничестве и злоупотреблениях от 1986 года и Законом о защите национальной информационной инфраструктуры от 1996 года (см.S.C. §§ 1001 и 1030).

Чтобы гарантировать, что наш веб-сайт хорошо работает для всех пользователей, SEC отслеживает частоту запросов на контент SEC. gov, чтобы гарантировать, что автоматический поиск не повлияет на способность других получать доступ к контенту SEC.gov. Мы оставляем за собой право блокировать IP-адреса, отправляющие чрезмерные запросы. Текущие правила ограничивают количество пользователей до 10 запросов в секунду, независимо от количества компьютеров, используемых для отправки запросов.

Если пользователь или приложение отправляет более 10 запросов в секунду, дальнейшие запросы с IP-адреса(ов) могут быть ограничены на короткий период.Как только количество запросов упадет ниже порогового значения на 10 минут, пользователь может возобновить доступ к контенту на SEC.gov. Эта практика SEC предназначена для ограничения чрезмерных автоматических поисков на SEC.gov и не предназначена и не предназначена для воздействия на отдельных лиц, просматривающих веб-сайт SEC.gov.

Обратите внимание, что эта политика может измениться, поскольку SEC управляет SEC.gov, чтобы обеспечить эффективную работу веб-сайта и его доступность для всех пользователей.

Примечание: Мы не предлагаем техническую поддержку для разработки или отладки процессов загрузки по сценарию.

30 вопросов для проверки специалиста по обработке и анализу данных по древовидным моделям

Введение

Деревья решений — один из самых уважаемых алгоритмов в машинном обучении и науке о данных. Они прозрачны, просты для понимания, надежны по своей природе и широко применимы. На самом деле вы можете увидеть, что делает алгоритм и какие шаги он выполняет, чтобы найти решение. Эта черта особенно важна в бизнес-контексте, когда речь идет об объяснении решения заинтересованным сторонам.

Этот тест на умение был специально разработан для того, чтобы вы могли проверить свои знания в области методов дерева решений. Для участия в тестировании зарегистрировалось более 750 человек. Если вы один из тех, кто пропустил этот тест навыков, вот вопросы и решения.

Вот таблица лидеров участников, прошедших тест.

 

Полезные ресурсы

Вот некоторые ресурсы, которые помогут вам получить более глубокие знания в этой области.

Вы новичок в машинном обучении? Хотите освоить алгоритмы машинного обучения, такие как Random Forest и XGBoost? Вот комплексный курс, подробно описывающий алгоритмы машинного обучения и глубокого обучения —

.

 

Проверка навыков Вопросы и ответы

1) Что из следующего верно/верно в отношении деревьев мешков?

  1. В деревьях упаковки отдельные деревья не зависят друг от друга
  2. Бэггинг — это метод повышения производительности путем агрегирования результатов слабых учащихся
  3. .

A) 1
B) 2
C) 1 и 2
D) Ни один из этих

Решение: C

Верны оба варианта.В бэггинге каждое отдельное дерево не зависит друг от друга, потому что они учитывают разные подмножества функций и выборок.

 

2) Что из следующего верно/верно в отношении повышения деревьев?

  1. При повышении деревьев отдельные слабые ученики не зависят друг от друга
  2. Это метод повышения производительности путем агрегирования результатов слабых учащихся

A) 1
B) 2
C) 1 и 2
D) Ни один из этих

Решение: B

В повышающем дереве отдельные слабые ученики не независимы друг от друга, потому что каждое дерево корректирует результаты предыдущего дерева. Упаковку и повышение можно рассматривать как улучшение базовых результатов учащихся.

 

3) Что из следующего является верным в отношении ансамблевых методов Random Forest и Gradient Boosting?

  1. Оба метода могут использоваться для задачи классификации
  2. Random Forest используется для классификации, тогда как Gradient Boosting используется для задачи регрессии
  3. Random Forest используется для регрессии, тогда как Gradient Boosting используется для задачи классификации
  4. Оба метода можно использовать для задачи регрессии

A) 1
B) 2
C) 3
D) 4
E) 1 и 4

Решение: E

Оба алгоритма предназначены для задач классификации и регрессии.

 

4) В случайном лесу вы можете генерировать сотни деревьев (скажем, T1, T2 …..Tn), а затем объединять результаты этих деревьев. Что из следующего верно для отдельного (Tk) дерева в случайном лесу?

  1. Отдельное дерево построено на подмножестве функций
  2. Индивидуальное дерево построено на основе всех функций
  3. Отдельное дерево построено на подмножестве наблюдений
  4. Отдельное дерево построено на полном наборе наблюдений

A) 1 и 3
B) 1 и 4
C) 2 и 3
D) 2 и 4

Решение: А

Случайный лес основан на концепции мешков, которые учитывают фракцию выборки и фракцию признаков для построения отдельных деревьев.

 

5) Что из следующего верно относительно гиперпараметра «max_depth» в Gradient Boosting?

  1. Чем меньше параметр, тем лучше при одинаковой точности проверки
  2. Чем выше параметр, тем лучше при одинаковой точности проверки
  3. Увеличение значения max_depth может привести к превышению данных
  4. Увеличение значения max_depth может привести к недостаточному соответствию данных

A) 1 и 3
B) 1 и 4
C) 2 и 3
D) 2 и 4

Решение: А

Увеличение глубины от определенного значения глубины может перекрыть данные, и для двух значений глубины точность проверки одинакова, мы всегда предпочитаем маленькую глубину в окончательном построении модели.

 

6) Какой из следующих алгоритмов не использует скорость обучения в качестве одного из своих гиперпараметров?

  1. Усиление градиента
  2. Дополнительные деревья
  3. АдаБуст
  4. Случайный лес

A) 1 и 3
B) 1 и 4
C) 2 и 3
D) 2 и 4

Решение: D

Random Forest и Extra Trees не имеют скорости обучения в качестве гиперпараметра.

 

7) Какой из следующих алгоритмов вы бы приняли во внимание при построении окончательной модели на основе производительности?

Предположим, вы дали следующий график, который показывает кривую ROC для двух разных алгоритмов классификации, таких как случайный лес (красный) и логистическая регрессия (синий)

A) Случайный лес
B) Логистическая регрессия
C) Оба вышеперечисленных
D) Ни один из этих

Решение: А

Поскольку Random forest имеет самый большой AUC, указанный на рисунке, поэтому я бы предпочел Random Forest

.

 

8) Что из следующего верно в отношении ошибки обучения и тестирования в таком случае?

Предположим, вы хотите применить алгоритм AdaBoost к данным D, содержащим T наблюдений.Вы устанавливаете половину данных для обучения и половину для тестирования изначально. Теперь вы хотите увеличить количество точек данных для обучения T1, T2… Tn, где T1 < T2…. Тн-1 < Тн.

A) Разница между ошибкой обучения и ошибкой теста увеличивается по мере увеличения количества наблюдений
B) Разница между ошибкой обучения и ошибкой теста уменьшается по мере увеличения количества наблюдений
C) Разница между ошибкой обучения и ошибкой теста не изменится
D ) Ни один из этих

Решение: B

По мере того, как у нас появляется все больше и больше данных, ошибка обучения увеличивается, а ошибка тестирования уменьшается.И все они сходятся к истинной ошибке.

 

9) В алгоритмах случайного леса или повышения градиента функции могут быть любого типа. Например, это может быть непрерывный признак или категориальный признак. Какой из следующих вариантов верен, когда вы рассматриваете эти типы функций?

A) Только алгоритм случайного леса обрабатывает атрибуты с действительными значениями путем их дискретизации
B) Только алгоритм повышения градиента обрабатывает атрибуты с действительными значениями путем их дискретизации
C) Оба алгоритма могут обрабатывать атрибуты с действительными значениями путем их дискретизации
D) Ни один из этих

Решение: C

Оба могут работать с реальными функциями.

 

10) Какой из следующих алгоритмов не является примером алгоритма обучения ансамбля?

A) Случайный лес
B) Adaboost
C) Дополнительные деревья
D) Повышение градиента
E) Деревья решений

Решение: E

Деревья решений не объединяют результаты нескольких деревьев, поэтому это не ансамблевый алгоритм.

 

11) Предположим, вы используете алгоритм на основе мешков, скажем, RandomForest при построении модели.Что из следующего может быть правдой?

  1. Количество деревьев должно быть как можно больше
  2. У вас появится интерпретируемость после использования RandomForest

A) 1
B) 2
C) 1 и 2
D) Ни один из этих

Решение: А

Поскольку случайный лес объединяет результаты разных слабых учеников, если это возможно, нам нужно больше деревьев в построении модели. Random Forest — это модель черного ящика, после использования которой вы потеряете интерпретируемость.

 

Контекст 12-15

Рассмотрите следующий рисунок, чтобы ответить на следующие несколько вопросов. На рисунке X1 и X2 — это две функции, а точка данных представлена ​​точками (-1 — отрицательный класс, а +1 — положительный класс). И вы сначала разделяете данные на основе функции X1 (скажем, точка разделения равна x11), которая показана на рисунке вертикальной линией. Каждое значение меньше x11 будет предсказано как положительный класс, а больше x будет предсказано как отрицательный класс.

12) Сколько точек данных неправильно классифицировано на изображении выше?

А) 1
Б) 2
В) 3
Г) 4

Решение: А

Неправильно классифицировано только одно наблюдение, один отрицательный класс показан слева от вертикальной линии, который будет предсказываться как положительный класс.

 

13) Какая из следующих точек разделения на признаке x1 будет правильно классифицировать данные?

A) Больше x11
B) Меньше x11
C) Равно x11
D) Ничего из вышеперечисленного

Решение: D

Если вы будете искать любую точку на X1, вы не найдете ни одной точки, которая дает 100% точность.

 

14) Если вы рассматриваете только функцию X2 для разделения. Можете ли вы теперь полностью отделить положительный класс от отрицательного класса для любого разделения на X2?

А) Да
Б) Нет

Решение: B

Тоже нельзя.

 

15) Теперь рассмотрим только одно разбиение на оба элемента (один на X1 и один на X2). Вы можете разделить обе функции в любой момент. Сможете ли вы правильно классифицировать все точки данных?

А) ВЕРНО
Б) НЕВЕРНО

Решение: B

Вы не найдете такого случая, потому что вы можете получить минимум 1 ошибочную классификацию.

 

Контекст 16-17

Предположим, вы работаете над задачей бинарной классификации с тремя входными признаками. И вы решили применить алгоритм упаковки (X) к этим данным. Вы выбрали max_features = 2 и n_estimators = 3. Теперь подумайте, что каждая оценка имеет точность 70%.

Примечание. Алгоритм X агрегирует результаты отдельных оценок на основе максимального голосования

16) Какую максимальную точность вы можете получить?

А) 70%
Б) 80%
В) 90%
Г) 100%

Решение: D

См. таблицу ниже для моделей M1, M2 и M3.

 

 

 

Фактические прогнозы М1 М2 М3 Выход
1 1 0 1 1
1 1 0 1 1
1 1 0 1 1
1 0 1 1 1
1 0 1 1 1
1 0 1 1 1
1 1 1 1 1
1 1 1 0 1
1 1 1 0 1
1 1 1 0 1

 

 

17) Какова минимальная точность, которую вы можете получить?

A) Всегда больше 70 %
B) Всегда больше 70 % и равно ему
C) Может быть меньше 70 %
D) Ни один из этих

Решение: C

См. таблицу ниже для моделей M1, M2 и M3.

Фактические прогнозы М1 М2 М3 Выход
1 1 0 0 0
1 1 1 1 1
1 1 0 0 0
1 0 1 0 0
1 0 1 1 1
1 0 0 1 0
1 1 1 1 1
1 1 1 1 1
1 1 1 1 1
1 1 1 1 1

 

18) Предположим, вы строите модель случайного леса, в которой узел разбивается по атрибуту с наибольшим приростом информации. На изображении ниже выберите атрибут с наибольшим информационным приростом?

 


A) Внешний вид
B) Влажность
C) Ветер
D) Температура

Решение: А

Прирост информации увеличивается со средней чистотой подмножеств. Так что вариант А будет правильным ответом.

 

19) Что из следующего верно относительно деревьев повышения градиента?

  1. На каждом этапе вводить новое дерево регрессии, чтобы компенсировать недостатки существующей модели
  2. Мы можем использовать градиентный метод для минимизации функции потерь

A) 1
B) 2
C) 1 и 2
D) Ни один из этих

Решение: C

Оба варианта верны и говорят сами за себя

 

20) Верно-неверно: Бэггинг подходит для моделей с высокой дисперсией и низким смещением?

A) ВЕРНО
B) НЕВЕРНО

Решение: А

Бэггинг подходит для моделей с высокой дисперсией и низким смещением или, можно сказать, для сложных моделей.


21) Что из следующего верно, когда вы выбираете долю наблюдений для построения базовых учеников в древовидном алгоритме?

A) Уменьшение доли выборок для построения базовой обучающей программы приведет к уменьшению дисперсии
B) Уменьшение доли выборки для построения базовой обучающей программы приведет к увеличению дисперсии
C) Увеличение доли выборки для построения базовой

учащиеся приведут к уменьшению дисперсии
D) Увеличьте долю выборок для построения базы

Решение: А

Ответ не требует пояснений

 

Контекст 22-23

Предположим, вы строите модель повышения градиента на данных, которые содержат миллионы наблюдений и тысячи признаков.Перед построением модели необходимо рассмотреть настройку параметра разности для измерения времени.


22) Рассмотрим гиперпараметр «количество деревьев» и расположим варианты по времени, затраченному каждым гиперпараметром на построение модели Gradient Boosting?

Примечание: остальные гиперпараметры такие же

  1. Количество деревьев = 100
  2. Количество деревьев = 500
  3. Количество деревьев = 1000

А) 1~2~3
В) 1<2<3

C) 1>2>3
D) Ни один из этих

Решение: B

Время, необходимое для постройки 1000 деревьев, является максимальным, а время, необходимое для постройки 100 деревьев, минимальным, что указано в решении B

.

 

23) Теперь рассмотрите гиперпараметр скорости обучения и расположите варианты с точки зрения времени, необходимого каждому гиперпараметру для построения модели повышения градиента?

Примечание. Остальные гиперпараметры такие же

1.скорость обучения = 1
2. скорость обучения = 2
3. скорость обучения = 3

А) 1~2~3
Б) 1<2<3

C) 1>2>3
D) Ни один из этих

Решение: А

Поскольку скорость обучения не влияет на время, все скорости обучения будут занимать одинаковое время.

 

24) При повышении градиента важно использовать скорость обучения для получения оптимального результата. Что из следующего верно относительно выбора скорости обучения?

A) Скорость обучения должна быть как можно выше
B) Скорость обучения должна быть как можно ниже
C) Скорость обучения должна быть низкой, но не очень низкой
D) Скорость обучения должна быть высокой, но не должна быть очень высокий

Решение: C

Скорость обучения должна быть низкой, но она не должна быть очень низкой, иначе алгоритму потребуется так много времени, чтобы завершить обучение, потому что вам нужно увеличить количество деревьев.

25) [Верно или неверно] Перекрестная проверка может использоваться для выбора количества итераций при бустинге; эта процедура может помочь уменьшить переоснащение.

А) ВЕРНО
Б) НЕВЕРНО

Решение: А

 

26) При использовании алгоритма повышения вы всегда учитываете слабых учеников. Что из следующего является основной причиной слабости учащихся?

  1. Для предотвращения переоснащения
  2. Для предотвращения подгонки

A) 1
B) 2
C) 1 и 2
D) Ни один из этих

Решение: А

Чтобы предотвратить переоснащение, поскольку сложность общего учащегося увеличивается с каждым шагом.Начиная со слабых учащихся, подразумевается, что окончательный классификатор с меньшей вероятностью будет переобучать.

 

27) Чтобы применить пакетирование к деревьям регрессии, что из следующего верно/верно в таком случае?

  1. Мы строим регрессию N с выборкой начальной загрузки N
  2. Берем среднее N дерева регрессии
  3. Каждое дерево имеет высокую дисперсию с низким смещением

A) 1 и 2
B) 2 и 3
C) 1 и 3
D) 1,2 и 3

Решение: D

Все варианты правильны и говорят сами за себя

 

28) Как выбрать лучшие гиперпараметры в древовидных моделях?

A) Измерение производительности по обучающим данным
B) Измерение производительности по проверочным данным
C) Оба из этих
D) Ни один из этих

Решение: B

Мы всегда рассматриваем результаты проверки для сравнения с результатом теста.

 

29) В каком из следующих сценариев коэффициент усиления предпочтительнее, чем прирост информации?

A) Когда категориальная переменная имеет очень большое количество категорий
B) Когда категориальная переменная имеет очень мало категорий
C) Количество категорий не является причиной
D) Ни одна из этих

Решение: А

При проблемах с высокой кардинальностью предпочтение отдается коэффициенту усиления, а не методу получения информации.

 

30) Предположим, вы дали следующий сценарий для обучения и ошибки проверки для Gradient Boosting. Какой из следующих гиперпараметров вы бы выбрали в таком случае?

Сценарий Глубина Ошибка обучения Ошибка проверки
1 2 100 110
2 4 90 105
3 6 50 100
4 8 45 105
5 10 30 150

 

А) 1
Б) 2
В) 3
Г) 4

Решение: B

Сценарии 2 и 4 имеют одинаковую точность проверки, но мы бы выбрали 2, потому что чем меньше глубина, тем лучше гиперпараметр.

Оставить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован.